81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4305 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008244  Meso_4603  TniB  100 
 
 
293 aa  595  1e-169  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.956661  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4383  TniB  100 
 
 
293 aa  595  1e-169  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0720685  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4305  TniB  100 
 
 
293 aa  595  1e-169  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.893182  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4221  TniB  100 
 
 
293 aa  595  1e-169  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341366  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3006  TniB  79.57 
 
 
497 aa  362  3e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.270037  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4235  hypothetical protein  45.02 
 
 
292 aa  246  4e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.814526 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4580  TniB  42.22 
 
 
307 aa  210  3e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0157  transposition protein TniB  42.49 
 
 
286 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359337  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3259  TniB family protein  39.27 
 
 
289 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.112641 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3578  TniB family protein  41.45 
 
 
308 aa  207  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0550246  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4904  TniB  39.27 
 
 
289 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4044  NTP-binding protein TniB  42.12 
 
 
302 aa  202  6e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160827  normal  0.440608 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4973  NTP-binding protein TniB  42.12 
 
 
302 aa  202  6e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899984  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3009  hypothetical protein  42.12 
 
 
302 aa  202  6e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00246617 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6596  TniB family protein  39.21 
 
 
289 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1646  TniB  38.89 
 
 
300 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0124  putative NTP-binding protein TniB  37.68 
 
 
298 aa  194  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6260  TniB  37.59 
 
 
289 aa  192  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2523  TniB family protein  36.27 
 
 
301 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.122196 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1579  TniB family protein  35.54 
 
 
301 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0154252  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1174  transposition protein TniB  41.63 
 
 
302 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4979  TniB family protein  36.27 
 
 
301 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00635243 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1681  TniB family protein  35.21 
 
 
301 aa  186  3e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.844069  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2935  TniB family protein  35.21 
 
 
301 aa  186  3e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.734369  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4686  TniB family protein  34.28 
 
 
301 aa  176  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.60041  normal  0.0211663 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2647  TniB family protein  39.08 
 
 
298 aa  171  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.288166  normal  0.0374868 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2172  TniB family protein  39.08 
 
 
298 aa  171  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.248869  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1347  TniB family protein  39.08 
 
 
298 aa  171  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1223  TniB family protein  39.08 
 
 
298 aa  171  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.985075  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0203  TniB family protein  35.14 
 
 
296 aa  169  5e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000461538 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5461  TniB family protein  37.6 
 
 
297 aa  166  5.9999999999999996e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.93146  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4287  TniB  43.22 
 
 
440 aa  163  3e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.105258  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0188  urease, alpha subunit  32.72 
 
 
293 aa  159  4e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2504  transposon transposition helper protein C, putative  31.9 
 
 
294 aa  158  9e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.059168  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3048  TniB  32.63 
 
 
303 aa  155  9e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.37719 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1591  TniB  30.18 
 
 
313 aa  151  1e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.545721  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0694  TniB  30.18 
 
 
313 aa  151  1e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0057  transposition helper protein  30.32 
 
 
296 aa  138  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0219  TniB family protein  31.87 
 
 
325 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.858856  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4393  TniB  28.47 
 
 
292 aa  107  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2132  TniB family protein  30.26 
 
 
203 aa  107  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.521965  normal  0.0287257 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5454  TniB  36.84 
 
 
167 aa  94.7  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.487668  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5455  hypothetical protein  41.75 
 
 
135 aa  86.7  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.201732  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4507  TniB  25.36 
 
 
296 aa  79.7  0.00000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6544  hypothetical protein  23.25 
 
 
302 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2234  AAA ATPase  22.27 
 
 
304 aa  62.8  0.000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.389055  decreased coverage  0.000860852 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0007  AAA ATPase  24.7 
 
 
319 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0015  AAA ATPase  24.7 
 
 
319 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000241771 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0009  AAA ATPase  24.7 
 
 
319 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0992238  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0007  AAA ATPase  24.7 
 
 
319 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00746213  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3182  putative ATP/GTP-binding protein  22.57 
 
 
337 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18881  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0612  ATP/GTP-binding protein  22.57 
 
 
337 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.775808  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0976  TniB family protein  24.22 
 
 
276 aa  59.3  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.104789 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2351  hypothetical protein  25.27 
 
 
310 aa  58.5  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0363942 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1151  hypothetical protein  24.26 
 
 
278 aa  58.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.275843 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06218  hypothetical protein  24.69 
 
 
326 aa  57.8  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3151  hypothetical protein  25.19 
 
 
312 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5217  hypothetical protein  25.19 
 
 
312 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.736835  normal  0.213042 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5057  hypothetical protein  25.19 
 
 
312 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.847367  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3219  ATP/GTP-binding protein  24.29 
 
 
342 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.184147  normal  0.517488 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3040  TniB  34.78 
 
 
98 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5592  AAA ATPase  25 
 
 
393 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5416  AAA ATPase  25 
 
 
393 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.740206 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1341  hypothetical protein  25.28 
 
 
268 aa  50.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.720259  normal  0.280158 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2187  hypothetical protein  22.57 
 
 
275 aa  50.4  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0883  hypothetical protein  23.15 
 
 
373 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2982  TniB family protein  22.22 
 
 
290 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4716  hypothetical protein  23.87 
 
 
354 aa  47.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4753  hypothetical protein  28.76 
 
 
362 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.713653  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0376  hypothetical protein  23.17 
 
 
330 aa  47.8  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0016  AAA ATPase  23.31 
 
 
312 aa  46.6  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0497  hypothetical protein  24.1 
 
 
377 aa  46.2  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.129503  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4576  AAA ATPase  26.79 
 
 
345 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3503  AAA ATPase  26.79 
 
 
345 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06977  hypothetical protein  26.17 
 
 
196 aa  43.9  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6967  Tn7-like transposition protein C  20.5 
 
 
540 aa  43.5  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.827899  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2176  hypothetical protein  22.46 
 
 
316 aa  43.1  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.476118  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3488  Tn7-like transposition protein C  29.38 
 
 
556 aa  42.7  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00656002  normal  0.0745204 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0026  hypothetical protein  24.03 
 
 
379 aa  42.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0029  transposition helper protein  23.08 
 
 
311 aa  42.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1872  Tn7-like transposition protein C  23.24 
 
 
551 aa  42.4  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>