86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_pSN254_0157 on replicon NC_009140
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009140  SNSL254_pSN254_0157  transposition protein TniB  100 
 
 		 286 aa  574  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3009  hypothetical protein  97.19 
 
 		 302 aa  554  1e-157  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00246617 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4044  NTP-binding protein TniB  97.19 
 
 		 302 aa  554  1e-157  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160827  normal  0.440608 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4973  NTP-binding protein TniB  97.19 
 
 		 302 aa  554  1e-157  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899984  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1174  transposition protein TniB  96.14 
 
 		 302 aa  528  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3578  TniB family protein  74.55 
 
 		 308 aa  419  1e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0550246  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0124  putative NTP-binding protein TniB  49.07 
 
 		 298 aa  263  3e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2172  TniB family protein  51.61 
 
 		 298 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.248869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2647  TniB family protein  51.61 
 
 		 298 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.288166  normal  0.0374868 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1223  TniB family protein  51.61 
 
 		 298 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.985075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1347  TniB family protein  51.61 
 
 		 298 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4235  hypothetical protein  48.58 
 
 		 292 aa  237  1e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.814526 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6596  TniB family protein  45.36 
 
 		 289 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1646  TniB  43.07 
 
 		 300 aa  226  3e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6260  TniB  45.59 
 
 		 289 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4904  TniB  43.22 
 
 		 289 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3259  TniB family protein  43.22 
 
 		 289 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.112641 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0203  TniB family protein  39.63 
 
 		 296 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000461538 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4603  TniB  43.67 
 
 		 293 aa  192  4e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.956661  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4383  TniB  43.67 
 
 		 293 aa  192  4e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0720685  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4221  TniB  43.67 
 
 		 293 aa  192  4e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341366  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4305  TniB  43.67 
 
 		 293 aa  192  4e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.893182  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1681  TniB family protein  34.64 
 
 		 301 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.844069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2935  TniB family protein  34.64 
 
 		 301 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.734369  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2523  TniB family protein  35.61 
 
 		 301 aa  186  3e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.122196 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1579  TniB family protein  35.36 
 
 		 301 aa  186  3e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0154252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4686  TniB family protein  37.73 
 
 		 301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.60041  normal  0.0211663 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4979  TniB family protein  35.61 
 
 		 301 aa  183  3e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635243 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4580  TniB  40.37 
 
 		 307 aa  182  6e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2504  transposon transposition helper protein C, putative  36.13 
 
 		 294 aa  181  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.059168  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0188  urease, alpha subunit  38.98 
 
 		 293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0057  transposition helper protein  35.79 
 
 		 296 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1591  TniB  32.84 
 
 		 313 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.545721  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0694  TniB  32.84 
 
 		 313 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3048  TniB  33.21 
 
 		 303 aa  160  3e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.37719 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3006  TniB  43.72 
 
 		 497 aa  158  8e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.270037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5461  TniB family protein  34.17 
 
 		 297 aa  135  6.0000000000000005e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.93146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4393  TniB  32.82 
 
 		 292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2132  TniB family protein  35.53 
 
 		 203 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.521965  normal  0.0287257 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0219  TniB family protein  29.96 
 
 		 325 aa  129  7.000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.858856  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4287  TniB  37.68 
 
 		 440 aa  123  4e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.105258  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4507  TniB  32.23 
 
 		 296 aa  115  8.999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5454  TniB  37.24 
 
 		 167 aa  80.5  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.487668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6544  hypothetical protein  23.69 
 
 		 302 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5455  hypothetical protein  38.68 
 
 		 135 aa  72  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.201732  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0015  AAA ATPase  27.43 
 
 		 319 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000241771 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0007  AAA ATPase  27.43 
 
 		 319 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0009  AAA ATPase  27.43 
 
 		 319 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0992238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0007  AAA ATPase  27.43 
 
 		 319 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00746213  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3219  ATP/GTP-binding protein  25.81 
 
 		 342 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.184147  normal  0.517488 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2351  hypothetical protein  34.15 
 
 		 310 aa  65.5  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0363942 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06218  hypothetical protein  25.99 
 
 		 326 aa  65.5  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1151  hypothetical protein  24.91 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.275843 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3182  putative ATP/GTP-binding protein  23.89 
 
 		 337 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0612  ATP/GTP-binding protein  23.89 
 
 		 337 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.775808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2234  AAA ATPase  25.94 
 
 		 304 aa  60.1  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.389055  decreased coverage  0.000860852 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0976  TniB family protein  25.36 
 
 		 276 aa  59.7  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.104789 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5057  hypothetical protein  24.55 
 
 		 312 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.847367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3040  TniB  35.71 
 
 		 98 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5217  hypothetical protein  24.55 
 
 		 312 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.736835  normal  0.213042 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3151  hypothetical protein  24.55 
 
 		 312 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2187  hypothetical protein  24.8 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0016  AAA ATPase  20.68 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2982  TniB family protein  23.48 
 
 		 290 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2603  AAA ATPase  27.71 
 
 		 377 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0342788  normal  0.397066 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3861  hypothetical protein  25 
 
 		 319 aa  52.4  0.000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0197504 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0026  hypothetical protein  24.35 
 
 		 379 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4199  hypothetical protein  23.6 
 
 		 340 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06977  hypothetical protein  28.86 
 
 		 196 aa  50.1  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1703  hypothetical protein  24.05 
 
 		 322 aa  48.5  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4716  AAA ATPase  25.96 
 
 		 344 aa  47.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0132435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3128  uncharacterized ATPase putative transposase  20.87 
 
 		 276 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.765042 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2200  uncharacterized ATPase putative transposase  20.87 
 
 		 276 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.866593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4716  hypothetical protein  21.83 
 
 		 354 aa  47.4  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4576  AAA ATPase  25.9 
 
 		 345 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1872  Tn7-like transposition protein C  21.55 
 
 		 551 aa  45.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3503  AAA ATPase  25.9 
 
 		 345 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11320  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  28.89 
 
 		 846 aa  45.4  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.952833  normal  0.628396 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1365  hypothetical protein  24 
 
 		 355 aa  45.4  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0838542  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0029  transposition helper protein  22.87 
 
 		 311 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7025  Tn7-like transposition protein C  26.45 
 
 		 352 aa  44.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.388572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3569  AAA ATPase  25.82 
 
 		 338 aa  43.5  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.628974 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5416  AAA ATPase  24.9 
 
 		 393 aa  43.5  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.740206 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5592  AAA ATPase  24.9 
 
 		 393 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1115  Tn7-like transposition protein C  26 
 
 		 551 aa  43.1  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3488  Tn7-like transposition protein C  25.76 
 
 		 556 aa  42.4  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00656002  normal  0.0745204 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>