15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1365 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1365  hypothetical protein  100 
 
 		 355 aa  727    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0838542  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2351  hypothetical protein  24.89 
 
 		 310 aa  94.4  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0363942 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0015  AAA ATPase  24.28 
 
 		 319 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000241771 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0007  AAA ATPase  24.28 
 
 		 319 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00746213  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0009  AAA ATPase  24.28 
 
 		 319 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0992238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0007  AAA ATPase  24.28 
 
 		 319 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3578  TniB family protein  23.64 
 
 		 308 aa  49.3  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0550246  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0188  urease, alpha subunit  26.87 
 
 		 293 aa  47.8  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3009  hypothetical protein  24.22 
 
 		 302 aa  47.4  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00246617 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4044  NTP-binding protein TniB  24.22 
 
 		 302 aa  47.4  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160827  normal  0.440608 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4973  NTP-binding protein TniB  24.22 
 
 		 302 aa  47.4  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899984  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0026  hypothetical protein  25.08 
 
 		 379 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0157  transposition protein TniB  24 
 
 		 286 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1174  transposition protein TniB  23.13 
 
 		 302 aa  43.5  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3660  hypothetical protein  27.18 
 
 		 329 aa  42.7  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>