93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3578 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3578  TniB family protein  100 
 
 		 308 aa  615  1e-175  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0550246  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4973  NTP-binding protein TniB  75.51 
 
 		 302 aa  445  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899984  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4044  NTP-binding protein TniB  75.51 
 
 		 302 aa  445  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160827  normal  0.440608 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3009  hypothetical protein  75.51 
 
 		 302 aa  445  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00246617 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1174  transposition protein TniB  75.85 
 
 		 302 aa  425  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0157  transposition protein TniB  74.55 
 
 		 286 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0124  putative NTP-binding protein TniB  45.71 
 
 		 298 aa  262  4.999999999999999e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1223  TniB family protein  49.32 
 
 		 298 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.985075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1347  TniB family protein  49.32 
 
 		 298 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2647  TniB family protein  49.32 
 
 		 298 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.288166  normal  0.0374868 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2172  TniB family protein  49.32 
 
 		 298 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.248869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1646  TniB  41.75 
 
 		 300 aa  248  1e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4235  hypothetical protein  47.62 
 
 		 292 aa  227  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.814526 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6596  TniB family protein  43.22 
 
 		 289 aa  210  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3259  TniB family protein  40.73 
 
 		 289 aa  208  8e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.112641 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4904  TniB  40.73 
 
 		 289 aa  208  8e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0203  TniB family protein  38.75 
 
 		 296 aa  208  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000461538 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6260  TniB  42.65 
 
 		 289 aa  208  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2523  TniB family protein  35.49 
 
 		 301 aa  203  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.122196 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1579  TniB family protein  35.31 
 
 		 301 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0154252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4979  TniB family protein  35.66 
 
 		 301 aa  200  3e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635243 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2935  TniB family protein  34.62 
 
 		 301 aa  199  3e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.734369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1681  TniB family protein  34.62 
 
 		 301 aa  199  3e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.844069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2504  transposon transposition helper protein C, putative  36.64 
 
 		 294 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.059168  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4603  TniB  42.97 
 
 		 293 aa  196  6e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.956661  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4383  TniB  42.97 
 
 		 293 aa  196  6e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0720685  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4305  TniB  42.97 
 
 		 293 aa  196  6e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.893182  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4221  TniB  42.97 
 
 		 293 aa  196  6e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341366  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4580  TniB  39.86 
 
 		 307 aa  194  1e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0188  urease, alpha subunit  37.72 
 
 		 293 aa  189  7e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4686  TniB family protein  35.66 
 
 		 301 aa  186  5e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.60041  normal  0.0211663 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0057  transposition helper protein  34.15 
 
 		 296 aa  185  9e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0694  TniB  33.45 
 
 		 313 aa  181  9.000000000000001e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1591  TniB  33.45 
 
 		 313 aa  181  9.000000000000001e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.545721  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3048  TniB  31.21 
 
 		 303 aa  162  8.000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.37719 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5461  TniB family protein  37.36 
 
 		 297 aa  158  8e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.93146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0219  TniB family protein  33.09 
 
 		 325 aa  152  8e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.858856  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4393  TniB  32.99 
 
 		 292 aa  149  4e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3006  TniB  41.67 
 
 		 497 aa  149  6e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.270037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2132  TniB family protein  38.46 
 
 		 203 aa  143  5e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.521965  normal  0.0287257 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4507  TniB  33.67 
 
 		 296 aa  127  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4287  TniB  37.38 
 
 		 440 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.105258  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5454  TniB  38.89 
 
 		 167 aa  94.4  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.487668  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0015  AAA ATPase  31.84 
 
 		 319 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000241771 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0007  AAA ATPase  31.84 
 
 		 319 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0009  AAA ATPase  31.84 
 
 		 319 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0992238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0007  AAA ATPase  31.84 
 
 		 319 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00746213  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1151  hypothetical protein  25.2 
 
 		 278 aa  74.3  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.275843 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5455  hypothetical protein  37.5 
 
 		 135 aa  72.8  0.000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.201732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2982  TniB family protein  24.49 
 
 		 290 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6544  hypothetical protein  24.28 
 
 		 302 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2187  hypothetical protein  24.49 
 
 		 275 aa  69.7  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2351  hypothetical protein  30.92 
 
 		 310 aa  68.6  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0363942 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0016  AAA ATPase  23.13 
 
 		 312 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06218  hypothetical protein  22.83 
 
 		 326 aa  63.9  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0976  TniB family protein  23.02 
 
 		 276 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.104789 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5217  hypothetical protein  25.86 
 
 		 312 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.736835  normal  0.213042 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3151  hypothetical protein  25.86 
 
 		 312 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5057  hypothetical protein  25.86 
 
 		 312 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.847367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3128  uncharacterized ATPase putative transposase  21.63 
 
 		 276 aa  59.3  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.765042 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2200  uncharacterized ATPase putative transposase  21.63 
 
 		 276 aa  59.3  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.866593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3219  ATP/GTP-binding protein  24.35 
 
 		 342 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.184147  normal  0.517488 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0026  hypothetical protein  24.54 
 
 		 379 aa  56.6  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2266  hypothetical protein  26.73 
 
 		 315 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.339393 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0612  ATP/GTP-binding protein  23.35 
 
 		 337 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.775808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3182  putative ATP/GTP-binding protein  23.35 
 
 		 337 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4576  AAA ATPase  25.75 
 
 		 345 aa  52  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3040  TniB  32.56 
 
 		 98 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3503  AAA ATPase  25.75 
 
 		 345 aa  52  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2234  AAA ATPase  22.47 
 
 		 304 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.389055  decreased coverage  0.000860852 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06977  hypothetical protein  27.52 
 
 		 196 aa  51.2  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0017  hypothetical protein  25.57 
 
 		 335 aa  50.4  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1365  hypothetical protein  23.64 
 
 		 355 aa  49.3  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0838542  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4753  hypothetical protein  23.75 
 
 		 362 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.713653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5416  AAA ATPase  22.64 
 
 		 393 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.740206 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2603  AAA ATPase  25.88 
 
 		 377 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0342788  normal  0.397066 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5592  AAA ATPase  22.64 
 
 		 393 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4199  hypothetical protein  26.92 
 
 		 340 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2930  hypothetical protein  29.29 
 
 		 530 aa  47.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4716  hypothetical protein  23.98 
 
 		 354 aa  47.8  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3861  hypothetical protein  27.82 
 
 		 319 aa  47  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0197504 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5193  Tn7-like transposition protein C  23.27 
 
 		 467 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3488  Tn7-like transposition protein C  29.58 
 
 		 556 aa  46.2  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00656002  normal  0.0745204 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3107  transposon Tn7 transposition protein C  25.16 
 
 		 490 aa  45.1  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0459795 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0312  ATPase AAA-2  23.16 
 
 		 803 aa  44.3  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2325  Tn7-like transposition protein C  27.27 
 
 		 568 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000840963 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2089  hypothetical protein  24.55 
 
 		 356 aa  43.9  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.705545  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1872  Tn7-like transposition protein C  22.18 
 
 		 551 aa  43.5  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11320  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  32.35 
 
 		 846 aa  43.5  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.952833  normal  0.628396 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7025  Tn7-like transposition protein C  25.3 
 
 		 352 aa  43.1  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.388572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0376  hypothetical protein  19.23 
 
 		 330 aa  42.7  0.008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1489  ATPase AAA-2 domain protein  25.1 
 
 		 813 aa  42.4  0.009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0883  hypothetical protein  24.48 
 
 		 373 aa  42.4  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>