61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5461 on replicon NC_010333
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010333  Caul_5461  TniB family protein  100 
 
 		 297 aa  591  1e-168  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.93146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5454  TniB  65.87 
 
 		 167 aa  215  5.9999999999999996e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.487668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4235  hypothetical protein  37.84 
 
 		 292 aa  170  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.814526 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3259  TniB family protein  37.5 
 
 		 289 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.112641 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4904  TniB  37.5 
 
 		 289 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6596  TniB family protein  36.43 
 
 		 289 aa  159  6e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4603  TniB  37.4 
 
 		 293 aa  159  6e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.956661  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4383  TniB  37.4 
 
 		 293 aa  159  6e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0720685  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4305  TniB  37.4 
 
 		 293 aa  159  6e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.893182  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4221  TniB  37.4 
 
 		 293 aa  159  6e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341366  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3578  TniB family protein  37.36 
 
 		 308 aa  158  8e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0550246  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5455  hypothetical protein  70.19 
 
 		 135 aa  157  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.201732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6260  TniB  33.82 
 
 		 289 aa  148  9e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4580  TniB  37.02 
 
 		 307 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0694  TniB  30.25 
 
 		 313 aa  144  1e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1591  TniB  30.25 
 
 		 313 aa  144  1e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.545721  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1646  TniB  32.23 
 
 		 300 aa  139  4.999999999999999e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0057  transposition helper protein  32.73 
 
 		 296 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0157  transposition protein TniB  34.17 
 
 		 286 aa  136  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4044  NTP-binding protein TniB  34.17 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160827  normal  0.440608 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4973  NTP-binding protein TniB  34.17 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899984  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3009  hypothetical protein  34.17 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00246617 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2523  TniB family protein  33.08 
 
 		 301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.122196 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1579  TniB family protein  33.33 
 
 		 301 aa  133  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0154252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2504  transposon transposition helper protein C, putative  34.36 
 
 		 294 aa  134  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.059168  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4287  TniB  40 
 
 		 440 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.105258  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0203  TniB family protein  32.85 
 
 		 296 aa  132  5e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000461538 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4979  TniB family protein  33.2 
 
 		 301 aa  132  5e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635243 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3048  TniB  32.2 
 
 		 303 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.37719 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0124  putative NTP-binding protein TniB  29.17 
 
 		 298 aa  129  6e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4686  TniB family protein  32.57 
 
 		 301 aa  129  8.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.60041  normal  0.0211663 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2935  TniB family protein  32.34 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.734369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1681  TniB family protein  32.34 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.844069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1174  transposition protein TniB  34.47 
 
 		 302 aa  126  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0188  urease, alpha subunit  29.06 
 
 		 293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1347  TniB family protein  35.27 
 
 		 298 aa  119  9e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2647  TniB family protein  35.27 
 
 		 298 aa  119  9e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.288166  normal  0.0374868 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2172  TniB family protein  35.27 
 
 		 298 aa  119  9e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.248869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1223  TniB family protein  35.27 
 
 		 298 aa  119  9e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.985075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0219  TniB family protein  25.29 
 
 		 325 aa  117  3e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.858856  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2132  TniB family protein  36.46 
 
 		 203 aa  115  6.9999999999999995e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.521965  normal  0.0287257 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3006  TniB  36.41 
 
 		 497 aa  113  3e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.270037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4393  TniB  27.06 
 
 		 292 aa  78.6  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4507  TniB  26.05 
 
 		 296 aa  57.4  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2234  AAA ATPase  25.59 
 
 		 304 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.389055  decreased coverage  0.000860852 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0017  hypothetical protein  26.57 
 
 		 335 aa  51.2  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0007  AAA ATPase  27.22 
 
 		 319 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00746213  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0009  AAA ATPase  27.22 
 
 		 319 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0992238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0007  AAA ATPase  27.22 
 
 		 319 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0015  AAA ATPase  27.22 
 
 		 319 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000241771 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3219  ATP/GTP-binding protein  26.29 
 
 		 342 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.184147  normal  0.517488 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3182  putative ATP/GTP-binding protein  26.72 
 
 		 337 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0612  ATP/GTP-binding protein  26.72 
 
 		 337 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.775808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06218  hypothetical protein  21.12 
 
 		 326 aa  44.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0471  peptidoglycan binding domain-containing protein  25.83 
 
 		 580 aa  44.3  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.194095 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4721  AAA ATPase  24.08 
 
 		 327 aa  43.9  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.895386  normal  0.068339 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0462  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  25.83 
 
 		 577 aa  44.3  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.388723  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3660  hypothetical protein  29.59 
 
 		 329 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1982  AAA ATPase  26.47 
 
 		 382 aa  43.1  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.135129 
 
 
-
 
NC_004310  BR0730  transposition protein, putative  23.97 
 
 		 316 aa  42.7  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.12407  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6544  hypothetical protein  23.13 
 
 		 302 aa  42.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.324447 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>