51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_2200 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_3128  uncharacterized ATPase putative transposase  100 
 
 
276 aa  564  1e-160  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.765042 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2200  uncharacterized ATPase putative transposase  100 
 
 
276 aa  564  1e-160  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.866593  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0976  TniB family protein  84.42 
 
 
276 aa  483  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.104789 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1151  hypothetical protein  61.54 
 
 
278 aa  351  1e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.275843 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1341  hypothetical protein  45.17 
 
 
268 aa  214  9.999999999999999e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.720259  normal  0.280158 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2187  hypothetical protein  44.49 
 
 
275 aa  204  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2982  TniB family protein  42.16 
 
 
290 aa  203  3e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2958  hypothetical protein  35.46 
 
 
211 aa  92.8  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2994  hypothetical protein  27.85 
 
 
296 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0118  hypothetical protein  31.44 
 
 
302 aa  79.7  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0113  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0242  hypothetical protein  31.44 
 
 
302 aa  79.7  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000407838  hitchhiker  0.00123645 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2452  hypothetical protein  31.44 
 
 
302 aa  79.7  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00352703  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0203  TniB family protein  25.86 
 
 
296 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000461538 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2504  transposon transposition helper protein C, putative  26.58 
 
 
294 aa  70.1  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.059168  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0124  putative NTP-binding protein TniB  27.11 
 
 
298 aa  69.3  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1646  TniB  27.56 
 
 
300 aa  68.2  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0016  AAA ATPase  25.86 
 
 
312 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3259  TniB family protein  27.38 
 
 
289 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.112641 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4904  TniB  27.38 
 
 
289 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0188  urease, alpha subunit  25.2 
 
 
293 aa  65.1  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3578  TniB family protein  21.63 
 
 
308 aa  59.3  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0550246  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0694  TniB  22.99 
 
 
313 aa  57.8  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1591  TniB  22.99 
 
 
313 aa  57.8  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.545721  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6544  hypothetical protein  27.54 
 
 
302 aa  54.3  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3048  TniB  26.32 
 
 
303 aa  54.3  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.37719 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6596  TniB family protein  23.39 
 
 
289 aa  53.1  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2953  hypothetical protein  28.26 
 
 
183 aa  52.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1612  hypothetical protein  26 
 
 
239 aa  50.4  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.111767  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0612  ATP/GTP-binding protein  24.39 
 
 
337 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.775808  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3182  putative ATP/GTP-binding protein  24.39 
 
 
337 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18881  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3219  ATP/GTP-binding protein  22.92 
 
 
342 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.184147  normal  0.517488 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4580  TniB  23.89 
 
 
307 aa  48.9  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4973  NTP-binding protein TniB  21.13 
 
 
302 aa  48.5  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899984  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3009  hypothetical protein  21.13 
 
 
302 aa  48.5  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00246617 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4044  NTP-binding protein TniB  21.13 
 
 
302 aa  48.5  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160827  normal  0.440608 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0157  transposition protein TniB  20.87 
 
 
286 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359337  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0221  ATP-binding protein  27.64 
 
 
270 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00123025 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0071  ATP-binding protein  27.64 
 
 
270 aa  47  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.721813  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3351  bacteriophage DNA transposition B protein, putative  24.44 
 
 
234 aa  46.6  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.382717  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0219  TniB family protein  24.02 
 
 
325 aa  46.2  0.0006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.858856  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4235  hypothetical protein  24.09 
 
 
292 aa  45.8  0.0009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.814526 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06218  hypothetical protein  23.48 
 
 
326 aa  45.4  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6260  TniB  23.79 
 
 
289 aa  45.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0009  AAA ATPase  24.24 
 
 
319 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0992238  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0015  AAA ATPase  24.24 
 
 
319 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000241771 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2655  prophage MuSo2, DNA transposition protein, putative  24.75 
 
 
318 aa  43.9  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0007  AAA ATPase  24.24 
 
 
319 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00746213  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0007  AAA ATPase  24.24 
 
 
319 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4393  TniB  25.11 
 
 
292 aa  42.4  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0253  hypothetical protein  28.29 
 
 
301 aa  42.4  0.008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2499  peptidoglycan binding domain-containing protein  24.29 
 
 
562 aa  42.4  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000546942 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>