25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2655 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2655  prophage MuSo2, DNA transposition protein, putative  100 
 
 		 318 aa  647    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0786  DNA transposition protein  65.41 
 
 		 314 aa  416  9.999999999999999e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000808918  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0651  DNA transposition protein  65.41 
 
 		 314 aa  416  9.999999999999999e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00310883  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1664  DNA transposition protein (gpB)  37.15 
 
 		 324 aa  194  2e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4524  B transposition domain-containing protein  31.49 
 
 		 319 aa  160  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3067  hypothetical protein  29.1 
 
 		 347 aa  126  5e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.462642  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3033  hypothetical protein  28.25 
 
 		 343 aa  119  9e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00438308  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4216  Putative ATPase, transposase-like protein  27.62 
 
 		 310 aa  93.6  5e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0215  XRE family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 296 aa  88.2  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.046425  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0269  bacteriophage DNA transposition protein B, putative  28.34 
 
 		 307 aa  84  0.000000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0412  putative phage DNA transposition protein  29.59 
 
 		 343 aa  62  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00594514  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1564  hypothetical protein  24.74 
 
 		 240 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370526 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0099  hypothetical protein  23.17 
 
 		 256 aa  50.1  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.253921 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1612  hypothetical protein  24.21 
 
 		 239 aa  48.5  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.111767  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0144  AAA ATPase  25.39 
 
 		 349 aa  47.8  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5077  sporulation domain protein  33.91 
 
 		 529 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.560536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0253  hypothetical protein  31.53 
 
 		 301 aa  46.2  0.0007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3749  ATPase  30.53 
 
 		 271 aa  45.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1265  bacteriophage DNA transposition B protein, putative  29.37 
 
 		 233 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.01342e-16 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2908  bacteriophage DNA transposition B protein  25.56 
 
 		 250 aa  44.3  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00692562  normal  0.135602 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2200  uncharacterized ATPase putative transposase  24.75 
 
 		 276 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.866593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3128  uncharacterized ATPase putative transposase  24.75 
 
 		 276 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.765042 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1622  exonuclease V subunit alpha  28.46 
 
 		 1112 aa  43.5  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3404  ATPas  29.44 
 
 		 459 aa  43.1  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4950  sporulation domain-containing protein  32.46 
 
 		 533 aa  42.7  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.663917  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>