25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3067 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3033  hypothetical protein  89.05 
 
 		 343 aa  650    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00438308  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3067  hypothetical protein  100 
 
 		 347 aa  725    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.462642  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4524  B transposition domain-containing protein  36.21 
 
 		 319 aa  180  4e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1664  DNA transposition protein (gpB)  30.16 
 
 		 324 aa  142  6e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2655  prophage MuSo2, DNA transposition protein, putative  29.1 
 
 		 318 aa  125  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0786  DNA transposition protein  28.42 
 
 		 314 aa  100  5e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000808918  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0651  DNA transposition protein  28.42 
 
 		 314 aa  100  5e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00310883  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4216  Putative ATPase, transposase-like protein  25.78 
 
 		 310 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0215  XRE family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.046425  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0269  bacteriophage DNA transposition protein B, putative  28.52 
 
 		 307 aa  66.2  0.0000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0390  MSHA biogenesis protein MshM  26.88 
 
 		 301 aa  49.7  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1924  hypothetical protein  29.19 
 
 		 414 aa  49.3  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.42704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3485  MSHA biogenesis protein MshM  25.74 
 
 		 310 aa  46.2  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.607813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0467  MSHA biogenesis protein MshM  25.74 
 
 		 309 aa  46.2  0.0009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1564  hypothetical protein  23 
 
 		 240 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370526 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3662  MSHA biogenesis protein MshM  25.74 
 
 		 309 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3750  MSHA biogenesis protein MshM  27.17 
 
 		 314 aa  45.8  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.995764  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4111  MSHA biogenesis protein MshM  27.01 
 
 		 310 aa  45.4  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2499  peptidoglycan binding domain-containing protein  25.62 
 
 		 562 aa  45.1  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000546942 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0412  putative phage DNA transposition protein  23.18 
 
 		 343 aa  45.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00594514  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0561  MSHA biogenesis protein MshM  25.86 
 
 		 308 aa  44.7  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002369  MSHA biogenesis protein MshM  28.69 
 
 		 261 aa  43.9  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2688  general secretion pathway protein A  25.16 
 
 		 519 aa  43.1  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.387594  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3388  hypothetical protein  27.96 
 
 		 332 aa  42.7  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1587  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.62 
 
 		 562 aa  42.7  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0587648  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>