48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0269 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0269  bacteriophage DNA transposition protein B, putative  100 
 
 
307 aa  621  1e-177  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0215  XRE family transcriptional regulator  28.24 
 
 
296 aa  99.8  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.046425  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2655  prophage MuSo2, DNA transposition protein, putative  28.34 
 
 
318 aa  84  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1664  DNA transposition protein (gpB)  27.1 
 
 
324 aa  82  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4524  B transposition domain-containing protein  24.92 
 
 
319 aa  81.6  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0412  putative phage DNA transposition protein  29.91 
 
 
343 aa  79.7  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00594514  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4384  ATP-binding protein  27.68 
 
 
270 aa  79.7  0.00000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0786  DNA transposition protein  27.86 
 
 
314 aa  72.8  0.000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000808918  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0651  DNA transposition protein  27.86 
 
 
314 aa  72.8  0.000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00310883  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0346  ATP-binding protein  25.55 
 
 
272 aa  70.9  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4216  Putative ATPase, transposase-like protein  25.69 
 
 
310 aa  69.7  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1564  hypothetical protein  25.25 
 
 
240 aa  67  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00370526 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1612  hypothetical protein  26.05 
 
 
239 aa  65.9  0.0000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.111767  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3033  hypothetical protein  26.67 
 
 
343 aa  64.7  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00438308  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3067  hypothetical protein  29.75 
 
 
347 aa  62.4  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.462642  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0253  hypothetical protein  26.61 
 
 
301 aa  61.6  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0071  ATP-binding protein  22.96 
 
 
270 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.721813  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2744  hypothetical protein  22.71 
 
 
271 aa  55.8  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.795386  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2821  potential ATP-binding protein  22.71 
 
 
271 aa  55.8  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.804922  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1875  AAA ATPase  24.8 
 
 
266 aa  53.5  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.871076  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1329  AAA ATPase  24.8 
 
 
266 aa  53.5  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1106  AAA ATPase  24.8 
 
 
266 aa  53.5  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.597508  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0545  AAA ATPase  24.8 
 
 
266 aa  53.5  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0382  AAA ATPase  24.8 
 
 
266 aa  53.5  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0221  ATP-binding protein  22.22 
 
 
270 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00123025 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4083  ATP-binding protein  27.74 
 
 
274 aa  50.4  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.309906  normal  0.0721991 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3874  ATP-binding protein  27.74 
 
 
274 aa  50.4  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.634834 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3678  ATP-binding protein  27.74 
 
 
274 aa  50.4  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.478693 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5571  AAA ATPase  26.51 
 
 
271 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.800357  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2381  AAA ATPase family protein  28.14 
 
 
251 aa  47  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5447  AAA ATPase  24.3 
 
 
271 aa  45.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.739293  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1265  bacteriophage DNA transposition B protein, putative  25.13 
 
 
233 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.01342e-16 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3753  prophage MuSo1, DNA transposition protein, putative  28.79 
 
 
241 aa  45.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2120  hypothetical protein  28.47 
 
 
260 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1280  hypothetical protein  28.47 
 
 
260 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4120  bacteriophage DNA transposition B protein  27.63 
 
 
250 aa  44.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000206213 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0177  general secretion pathway ATPase protein  24.46 
 
 
584 aa  44.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2187  hypothetical protein  25.15 
 
 
275 aa  43.9  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4035  AAA ATPase  33.01 
 
 
532 aa  43.9  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.267259  normal  0.70324 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2954  prophage MuMc02, transposition protein B  24.48 
 
 
223 aa  43.1  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4212  putative general secretion pathway protein A  29.75 
 
 
563 aa  43.1  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2982  TniB family protein  24.66 
 
 
290 aa  42.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2502  AAA ATPase  25.12 
 
 
271 aa  42.4  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.747208 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1689  AAA ATPase  25.12 
 
 
271 aa  42.4  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0572  AAA ATPase  25.12 
 
 
271 aa  42.4  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0555  AAA ATPase  25.12 
 
 
271 aa  42.4  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2927  AAA ATPase  25.12 
 
 
271 aa  42.4  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.600702  normal  0.252794 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2908  bacteriophage DNA transposition B protein  26.97 
 
 
250 aa  42.4  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00692562  normal  0.135602 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>