18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2954 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2954  prophage MuMc02, transposition protein B  100 
 
 		 223 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1280  hypothetical protein  40.19 
 
 		 260 aa  161  8.000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2120  hypothetical protein  40.19 
 
 		 260 aa  161  8.000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0647  transposase protein B  33.33 
 
 		 256 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3367  transposase protein B  30.73 
 
 		 264 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0644  prophage MuSo1, DNA transposition protein, putative  27.57 
 
 		 239 aa  96.3  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3753  prophage MuSo1, DNA transposition protein, putative  32.23 
 
 		 241 aa  96.3  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2069  prophage MuSo1, DNA transposition protein, putative  27.31 
 
 		 240 aa  90.5  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00213879  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2116  prophage MuSo1, DNA transposition protein, putative  27.31 
 
 		 240 aa  90.5  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0480615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2381  AAA ATPase family protein  28.24 
 
 		 251 aa  78.6  0.00000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2908  bacteriophage DNA transposition B protein  26.36 
 
 		 250 aa  70.5  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00692562  normal  0.135602 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4120  bacteriophage DNA transposition B protein  26.36 
 
 		 250 aa  69.3  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000206213 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0714  bacteriophage DNA transposition B protein  21.8 
 
 		 260 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1265  bacteriophage DNA transposition B protein, putative  26.9 
 
 		 233 aa  49.7  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.01342e-16 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0215  XRE family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 296 aa  49.3  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.046425  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0253  hypothetical protein  27.63 
 
 		 301 aa  45.1  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0269  bacteriophage DNA transposition protein B, putative  24.48 
 
 		 307 aa  43.1  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3351  bacteriophage DNA transposition B protein, putative  22.28 
 
 		 234 aa  42.7  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.382717  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>