32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0714 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0714  bacteriophage DNA transposition B protein  100 
 
 
260 aa  531  1e-150  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4120  bacteriophage DNA transposition B protein  36.19 
 
 
250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000206213 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2908  bacteriophage DNA transposition B protein  36.58 
 
 
250 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00692562  normal  0.135602 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0644  prophage MuSo1, DNA transposition protein, putative  30 
 
 
239 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2069  prophage MuSo1, DNA transposition protein, putative  33.67 
 
 
240 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00213879  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2116  prophage MuSo1, DNA transposition protein, putative  33.67 
 
 
240 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0480615  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3753  prophage MuSo1, DNA transposition protein, putative  30.53 
 
 
241 aa  108  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2381  AAA ATPase family protein  28.97 
 
 
251 aa  105  9e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3351  bacteriophage DNA transposition B protein, putative  29.96 
 
 
234 aa  92  8e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.382717  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0647  transposase protein B  28.32 
 
 
256 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1265  bacteriophage DNA transposition B protein, putative  27.63 
 
 
233 aa  72.4  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.01342e-16 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4384  ATP-binding protein  34.65 
 
 
270 aa  70.9  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1280  hypothetical protein  24.89 
 
 
260 aa  70.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2120  hypothetical protein  24.89 
 
 
260 aa  70.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0221  ATP-binding protein  25.29 
 
 
270 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00123025 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0071  ATP-binding protein  24.9 
 
 
270 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.721813  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3678  ATP-binding protein  31.5 
 
 
274 aa  61.6  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.478693 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4083  ATP-binding protein  31.5 
 
 
274 aa  61.6  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.309906  normal  0.0721991 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3874  ATP-binding protein  31.5 
 
 
274 aa  61.6  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.634834 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0215  XRE family transcriptional regulator  23.94 
 
 
296 aa  59.3  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.046425  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3367  transposase protein B  25.36 
 
 
264 aa  56.2  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1989  AAA ATPase  24.18 
 
 
268 aa  55.8  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0346  ATP-binding protein  26.77 
 
 
272 aa  55.5  0.0000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2954  prophage MuMc02, transposition protein B  21.8 
 
 
223 aa  51.2  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1895  Uncharacterized ATPase putative transposase  26.98 
 
 
283 aa  51.2  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.292876  normal  0.903317 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2234  AAA ATPase  27.65 
 
 
304 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.389055  decreased coverage  0.000860852 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3388  hypothetical protein  29.45 
 
 
332 aa  50.4  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2310  ATPase  27.75 
 
 
267 aa  44.3  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0976  TniB family protein  30.67 
 
 
276 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.104789 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0412  putative phage DNA transposition protein  30 
 
 
343 aa  42.7  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00594514  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2821  potential ATP-binding protein  25.23 
 
 
271 aa  42.4  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.804922  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2744  hypothetical protein  25.23 
 
 
271 aa  42.4  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.795386  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>