23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0412 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0412  putative phage DNA transposition protein  100 
 
 		 343 aa  692    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00594514  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0215  XRE family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.046425  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0269  bacteriophage DNA transposition protein B, putative  27.37 
 
 		 307 aa  83.6  0.000000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1664  DNA transposition protein (gpB)  26.05 
 
 		 324 aa  66.2  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4524  B transposition domain-containing protein  28.04 
 
 		 319 aa  65.5  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0786  DNA transposition protein  26.4 
 
 		 314 aa  65.9  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000808918  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0651  DNA transposition protein  26.4 
 
 		 314 aa  65.9  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00310883  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2655  prophage MuSo2, DNA transposition protein, putative  28.27 
 
 		 318 aa  65.1  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4216  Putative ATPase, transposase-like protein  25.96 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1564  hypothetical protein  28.12 
 
 		 240 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370526 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3033  hypothetical protein  22.47 
 
 		 343 aa  49.3  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00438308  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4120  bacteriophage DNA transposition B protein  30.77 
 
 		 250 aa  46.6  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000206213 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2908  bacteriophage DNA transposition B protein  30.23 
 
 		 250 aa  44.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00692562  normal  0.135602 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4384  ATP-binding protein  26.5 
 
 		 270 aa  45.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0221  ATP-binding protein  24.59 
 
 		 270 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00123025 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0253  hypothetical protein  23.08 
 
 		 301 aa  44.7  0.003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0071  ATP-binding protein  24.18 
 
 		 270 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.721813  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1989  AAA ATPase  26.43 
 
 		 268 aa  44.3  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0647  transposase protein B  35.25 
 
 		 256 aa  43.5  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2362  AAA ATPase  22.93 
 
 		 390 aa  43.1  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0976  TniB family protein  28.57 
 
 		 276 aa  42.7  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.104789 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0714  bacteriophage DNA transposition B protein  30 
 
 		 260 aa  42.7  0.009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3067  hypothetical protein  23.18 
 
 		 347 aa  42.7  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.462642  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>