20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1564 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1564  hypothetical protein  100 
 
 		 240 aa  487  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370526 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1612  hypothetical protein  59.32 
 
 		 239 aa  286  2e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.111767  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4524  B transposition domain-containing protein  29.36 
 
 		 319 aa  70.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0269  bacteriophage DNA transposition protein B, putative  25.25 
 
 		 307 aa  67  0.0000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1664  DNA transposition protein (gpB)  31.76 
 
 		 324 aa  67.4  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0412  putative phage DNA transposition protein  28.12 
 
 		 343 aa  61.2  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00594514  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0215  XRE family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.046425  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2655  prophage MuSo2, DNA transposition protein, putative  24.74 
 
 		 318 aa  55.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0786  DNA transposition protein  26.53 
 
 		 314 aa  54.3  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000808918  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0651  DNA transposition protein  26.53 
 
 		 314 aa  54.3  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00310883  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4216  Putative ATPase, transposase-like protein  25.73 
 
 		 310 aa  53.5  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4412  hypothetical protein  29.52 
 
 		 158 aa  51.2  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.451148  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2069  prophage MuSo1, DNA transposition protein, putative  25.41 
 
 		 240 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00213879  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2116  prophage MuSo1, DNA transposition protein, putative  25.41 
 
 		 240 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0480615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3033  hypothetical protein  22.56 
 
 		 343 aa  47.4  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00438308  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0099  hypothetical protein  29.57 
 
 		 256 aa  46.2  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.253921 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3067  hypothetical protein  23 
 
 		 347 aa  45.4  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.462642  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3190  AAA ATPase  26.32 
 
 		 388 aa  43.9  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0253  hypothetical protein  27.34 
 
 		 301 aa  42.4  0.006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2187  hypothetical protein  23.88 
 
 		 275 aa  42.4  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>