35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4524 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4524  B transposition domain-containing protein  100 
 
 		 319 aa  635    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1664  DNA transposition protein (gpB)  39.2 
 
 		 324 aa  202  4e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3067  hypothetical protein  36.09 
 
 		 347 aa  179  4e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.462642  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3033  hypothetical protein  35.92 
 
 		 343 aa  172  5.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00438308  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2655  prophage MuSo2, DNA transposition protein, putative  31.49 
 
 		 318 aa  160  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0786  DNA transposition protein  35.31 
 
 		 314 aa  154  2.9999999999999998e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000808918  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0651  DNA transposition protein  35.31 
 
 		 314 aa  154  2.9999999999999998e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00310883  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4216  Putative ATPase, transposase-like protein  27.84 
 
 		 310 aa  106  5e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0215  XRE family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 296 aa  87.8  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.046425  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0269  bacteriophage DNA transposition protein B, putative  24.92 
 
 		 307 aa  81.6  0.00000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1564  hypothetical protein  29.36 
 
 		 240 aa  70.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370526 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0412  putative phage DNA transposition protein  28.04 
 
 		 343 aa  65.5  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00594514  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0099  hypothetical protein  25.53 
 
 		 256 aa  54.3  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.253921 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0253  hypothetical protein  30.56 
 
 		 301 aa  53.9  0.000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3281  ATPase  26.97 
 
 		 303 aa  52.4  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0205  AAA ATPase  22.88 
 
 		 302 aa  52.4  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0382  AAA ATPase  24.07 
 
 		 266 aa  52.4  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1875  AAA ATPase  24.07 
 
 		 266 aa  52.4  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.871076  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1329  AAA ATPase  24.07 
 
 		 266 aa  52.4  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1106  AAA ATPase  24.07 
 
 		 266 aa  52.4  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.597508  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0545  AAA ATPase  24.07 
 
 		 266 aa  52.4  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1612  hypothetical protein  26.7 
 
 		 239 aa  52.4  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.111767  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4212  putative general secretion pathway protein A  23.33 
 
 		 563 aa  49.7  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0144  AAA ATPase  31.37 
 
 		 349 aa  48.5  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1014  hypothetical protein  33.94 
 
 		 281 aa  47.4  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3749  ATPase  25.19 
 
 		 271 aa  45.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1587  peptidoglycan binding domain-containing protein  26.07 
 
 		 562 aa  45.4  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0587648  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1071  AAA ATPase  25.71 
 
 		 388 aa  45.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.618974  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03091  putative ATPase and membrane protein  26.18 
 
 		 257 aa  43.9  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3190  AAA ATPase  25 
 
 		 388 aa  43.5  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0765  type II secretory pathway component ATPase  27.64 
 
 		 323 aa  43.5  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00521912  normal  0.0426164 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1766  peptidoglycan binding domain-containing protein  26.81 
 
 		 564 aa  42.7  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2509  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  29.93 
 
 		 353 aa  43.1  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.87412 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2688  general secretion pathway protein A  25 
 
 		 519 aa  42.4  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.387594  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3388  hypothetical protein  25.93 
 
 		 332 aa  42.7  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>