26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1664 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1664  DNA transposition protein (gpB)  100 
 
 		 324 aa  657    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4524  B transposition domain-containing protein  39.2 
 
 		 319 aa  202  4e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2655  prophage MuSo2, DNA transposition protein, putative  37.15 
 
 		 318 aa  194  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0786  DNA transposition protein  36.45 
 
 		 314 aa  188  1e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000808918  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0651  DNA transposition protein  36.45 
 
 		 314 aa  188  1e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00310883  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3067  hypothetical protein  30.16 
 
 		 347 aa  142  7e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.462642  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3033  hypothetical protein  29.51 
 
 		 343 aa  135  7.000000000000001e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00438308  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0215  XRE family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 296 aa  86.3  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.046425  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0269  bacteriophage DNA transposition protein B, putative  27.1 
 
 		 307 aa  82  0.00000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4216  Putative ATPase, transposase-like protein  25.43 
 
 		 310 aa  79.3  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1564  hypothetical protein  31.76 
 
 		 240 aa  67.4  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370526 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0412  putative phage DNA transposition protein  27.07 
 
 		 343 aa  63.5  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00594514  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0644  prophage MuSo1, DNA transposition protein, putative  29.19 
 
 		 239 aa  51.2  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0253  hypothetical protein  26.01 
 
 		 301 aa  50.1  0.00005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1265  bacteriophage DNA transposition B protein, putative  28.29 
 
 		 233 aa  50.1  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.01342e-16 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2509  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  30.15 
 
 		 353 aa  46.6  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.87412 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0144  AAA ATPase  31.21 
 
 		 349 aa  46.2  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1518  AAA ATPase  28.89 
 
 		 371 aa  45.8  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0414498  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1612  hypothetical protein  24.26 
 
 		 239 aa  45.8  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.111767  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3281  ATPase  28.03 
 
 		 303 aa  44.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0099  hypothetical protein  23.77 
 
 		 256 aa  45.1  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.253921 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4212  putative general secretion pathway protein A  29.25 
 
 		 563 aa  43.5  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0285  ATPase  33.61 
 
 		 341 aa  43.1  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0471  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.09 
 
 		 580 aa  43.1  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.194095 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0462  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  29.09 
 
 		 577 aa  43.1  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.388723  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3351  bacteriophage DNA transposition B protein, putative  27.7 
 
 		 234 aa  42.7  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.382717  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>