38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0644 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0644  prophage MuSo1, DNA transposition protein, putative  100 
 
 		 239 aa  494  1e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2069  prophage MuSo1, DNA transposition protein, putative  52.79 
 
 		 240 aa  250  2e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00213879  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2116  prophage MuSo1, DNA transposition protein, putative  52.79 
 
 		 240 aa  250  2e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0480615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3753  prophage MuSo1, DNA transposition protein, putative  37.87 
 
 		 241 aa  180  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2381  AAA ATPase family protein  31.38 
 
 		 251 aa  146  3e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1280  hypothetical protein  31.65 
 
 		 260 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2120  hypothetical protein  31.65 
 
 		 260 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0714  bacteriophage DNA transposition B protein  30 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0647  transposase protein B  31.38 
 
 		 256 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2908  bacteriophage DNA transposition B protein  29.29 
 
 		 250 aa  97.8  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00692562  normal  0.135602 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4120  bacteriophage DNA transposition B protein  29.29 
 
 		 250 aa  97.4  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000206213 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2954  prophage MuMc02, transposition protein B  27.57 
 
 		 223 aa  96.3  4e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3367  transposase protein B  28.38 
 
 		 264 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3351  bacteriophage DNA transposition B protein, putative  25.94 
 
 		 234 aa  68.2  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.382717  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1265  bacteriophage DNA transposition B protein, putative  24.78 
 
 		 233 aa  64.3  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.01342e-16 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0215  XRE family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 296 aa  57.4  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.046425  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1725  orc1/cdc6 family replication initiation protein  23.95 
 
 		 339 aa  52  0.000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1989  AAA ATPase  24.31 
 
 		 268 aa  52  0.000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1664  DNA transposition protein (gpB)  29.19 
 
 		 324 aa  51.2  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3678  ATP-binding protein  26.16 
 
 		 274 aa  49.7  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.478693 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3874  ATP-binding protein  26.16 
 
 		 274 aa  49.7  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.634834 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4083  ATP-binding protein  26.16 
 
 		 274 aa  49.7  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.309906  normal  0.0721991 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1887  orc1/cdc6 family replication initiation protein  27.16 
 
 		 336 aa  48.9  0.00008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0253  hypothetical protein  31.01 
 
 		 301 aa  47.8  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0221  ATP-binding protein  26.56 
 
 		 270 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00123025 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2234  AAA ATPase  27.23 
 
 		 304 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.389055  decreased coverage  0.000860852 
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5104  AAA ATPase  25.87 
 
 		 343 aa  43.5  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2537  hypothetical protein  27.72 
 
 		 357 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0071  ATP-binding protein  26.56 
 
 		 270 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.721813  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0533  AAA ATPase  31.88 
 
 		 266 aa  43.1  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1009  AAA ATPase  31.88 
 
 		 266 aa  43.1  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1286  AAA ATPase  31.88 
 
 		 266 aa  43.1  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2258  AAA ATPase  31.88 
 
 		 266 aa  43.1  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3236  AAA ATPase  31.88 
 
 		 266 aa  43.1  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4741  AAA ATPase  26.44 
 
 		 335 aa  43.1  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0001  ORC complex protein Cdc6/Orc1  25.6 
 
 		 396 aa  43.1  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.265686 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1703  hypothetical protein  24.27 
 
 		 322 aa  42  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1829  AAA ATPase  30.4 
 
 		 266 aa  41.6  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.569708 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>