32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_2069 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_2116  prophage MuSo1, DNA transposition protein, putative  100 
 
 
240 aa  496  1e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0480615  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2069  prophage MuSo1, DNA transposition protein, putative  100 
 
 
240 aa  496  1e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00213879  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0644  prophage MuSo1, DNA transposition protein, putative  52.79 
 
 
239 aa  250  2e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3753  prophage MuSo1, DNA transposition protein, putative  40 
 
 
241 aa  189  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2381  AAA ATPase family protein  35.47 
 
 
251 aa  162  3e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1280  hypothetical protein  32.3 
 
 
260 aa  133  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2120  hypothetical protein  32.3 
 
 
260 aa  133  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0647  transposase protein B  32.44 
 
 
256 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0714  bacteriophage DNA transposition B protein  33.67 
 
 
260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3367  transposase protein B  27.6 
 
 
264 aa  98.6  7e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2908  bacteriophage DNA transposition B protein  31.86 
 
 
250 aa  94  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00692562  normal  0.135602 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4120  bacteriophage DNA transposition B protein  31.37 
 
 
250 aa  91.3  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000206213 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2954  prophage MuMc02, transposition protein B  27.31 
 
 
223 aa  90.5  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3351  bacteriophage DNA transposition B protein, putative  28.22 
 
 
234 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.382717  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1265  bacteriophage DNA transposition B protein, putative  25.25 
 
 
233 aa  63.9  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.01342e-16 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0215  XRE family transcriptional regulator  25.71 
 
 
296 aa  55.5  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.046425  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0221  ATP-binding protein  24.9 
 
 
270 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00123025 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0071  ATP-binding protein  24.9 
 
 
270 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.721813  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0346  ATP-binding protein  26.98 
 
 
272 aa  53.9  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4384  ATP-binding protein  24.78 
 
 
270 aa  52.4  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2821  potential ATP-binding protein  24.08 
 
 
271 aa  50.1  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.804922  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2744  hypothetical protein  24.08 
 
 
271 aa  50.1  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.795386  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1989  AAA ATPase  23.53 
 
 
268 aa  50.4  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0253  hypothetical protein  31.2 
 
 
301 aa  48.1  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1564  hypothetical protein  25.41 
 
 
240 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00370526 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4083  ATP-binding protein  27.86 
 
 
274 aa  46.6  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.309906  normal  0.0721991 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3874  ATP-binding protein  27.86 
 
 
274 aa  46.6  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.634834 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3678  ATP-binding protein  27.86 
 
 
274 aa  46.6  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.478693 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2994  hypothetical protein  25 
 
 
296 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1913  AAA ATPase central domain protein  24.87 
 
 
497 aa  42.7  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0729  AAA ATPase central domain protein  25 
 
 
514 aa  42.4  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3011  replication factor C large subunit  26.02 
 
 
507 aa  42  0.01  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.379588  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>