43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1265 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1265  bacteriophage DNA transposition B protein, putative  100 
 
 		 233 aa  474  1e-133  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.01342e-16 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3351  bacteriophage DNA transposition B protein, putative  42.86 
 
 		 234 aa  176  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.382717  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2381  AAA ATPase family protein  31.63 
 
 		 251 aa  98.6  7e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3753  prophage MuSo1, DNA transposition protein, putative  30.99 
 
 		 241 aa  84.3  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0647  transposase protein B  33.48 
 
 		 256 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0714  bacteriophage DNA transposition B protein  27.63 
 
 		 260 aa  72.4  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2908  bacteriophage DNA transposition B protein  28.44 
 
 		 250 aa  66.2  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00692562  normal  0.135602 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4120  bacteriophage DNA transposition B protein  28.44 
 
 		 250 aa  65.9  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000206213 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1280  hypothetical protein  28.11 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0644  prophage MuSo1, DNA transposition protein, putative  24.78 
 
 		 239 aa  64.3  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2120  hypothetical protein  28.11 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2116  prophage MuSo1, DNA transposition protein, putative  25.25 
 
 		 240 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0480615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2069  prophage MuSo1, DNA transposition protein, putative  25.25 
 
 		 240 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00213879  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0215  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 296 aa  62  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.046425  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3367  transposase protein B  35.04 
 
 		 264 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4519  general secretion pathway protein-related protein  35.46 
 
 		 271 aa  58.5  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1286  general secretion pathway protein-related protein  35.46 
 
 		 271 aa  58.5  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.385442  normal  0.362438 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2048  general secretion pathway protein-related protein  35.46 
 
 		 271 aa  58.5  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00486349  hitchhiker  0.00515414 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4945  general secretion pathway protein-related protein  36.17 
 
 		 271 aa  58.5  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5447  AAA ATPase  38.35 
 
 		 271 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.739293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3743  general secretion pathway protein-related protein  35.94 
 
 		 301 aa  53.1  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110624  normal  0.122195 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1664  DNA transposition protein (gpB)  28.29 
 
 		 324 aa  50.1  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2927  AAA ATPase  37.59 
 
 		 271 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.600702  normal  0.252794 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0555  AAA ATPase  37.59 
 
 		 271 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0572  AAA ATPase  37.59 
 
 		 271 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1689  AAA ATPase  37.59 
 
 		 271 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2502  AAA ATPase  37.59 
 
 		 271 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.747208 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2954  prophage MuMc02, transposition protein B  26.9 
 
 		 223 aa  49.7  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5571  AAA ATPase  36.84 
 
 		 271 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.800357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2821  potential ATP-binding protein  28.1 
 
 		 271 aa  49.3  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.804922  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2744  hypothetical protein  28.1 
 
 		 271 aa  49.3  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.795386  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4083  ATP-binding protein  28.36 
 
 		 274 aa  48.9  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.309906  normal  0.0721991 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3874  ATP-binding protein  28.36 
 
 		 274 aa  48.9  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.634834 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3678  ATP-binding protein  28.36 
 
 		 274 aa  48.9  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.478693 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0253  hypothetical protein  23.93 
 
 		 301 aa  47.8  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0221  ATP-binding protein  27.82 
 
 		 270 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00123025 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0071  ATP-binding protein  27.07 
 
 		 270 aa  47  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.721813  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0269  bacteriophage DNA transposition protein B, putative  25.13 
 
 		 307 aa  45.8  0.0006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0786  DNA transposition protein  26.97 
 
 		 314 aa  45.1  0.0009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000808918  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0651  DNA transposition protein  26.97 
 
 		 314 aa  45.1  0.0009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00310883  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2655  prophage MuSo2, DNA transposition protein, putative  29.37 
 
 		 318 aa  44.7  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0706  orc1/cdc6 family replication initiation protein  27.73 
 
 		 340 aa  42.7  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1989  AAA ATPase  24.63 
 
 		 268 aa  42  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>