19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3678 on replicon NC_009955
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009955  Dshi_3678  ATP-binding protein  100 
 
 		 274 aa  565  1e-160  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.478693 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3874  ATP-binding protein  100 
 
 		 274 aa  565  1e-160  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.634834 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4083  ATP-binding protein  100 
 
 		 274 aa  565  1e-160  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.309906  normal  0.0721991 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4384  ATP-binding protein  54.51 
 
 		 270 aa  301  9e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0346  ATP-binding protein  55.97 
 
 		 272 aa  294  1e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0221  ATP-binding protein  46.07 
 
 		 270 aa  228  8e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00123025 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0071  ATP-binding protein  45.69 
 
 		 270 aa  226  4e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.721813  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2744  hypothetical protein  41.85 
 
 		 271 aa  213  2.9999999999999995e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.795386  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2821  potential ATP-binding protein  41.85 
 
 		 271 aa  213  2.9999999999999995e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.804922  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0714  bacteriophage DNA transposition B protein  31.5 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0215  XRE family transcriptional regulator  23.48 
 
 		 296 aa  53.1  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.046425  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3351  bacteriophage DNA transposition B protein, putative  26.52 
 
 		 234 aa  53.1  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.382717  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1895  Uncharacterized ATPase putative transposase  24.58 
 
 		 283 aa  51.2  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.292876  normal  0.903317 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0269  bacteriophage DNA transposition protein B, putative  27.74 
 
 		 307 aa  50.4  0.00003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0644  prophage MuSo1, DNA transposition protein, putative  26.16 
 
 		 239 aa  49.7  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1265  bacteriophage DNA transposition B protein, putative  28.36 
 
 		 233 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.01342e-16 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2116  prophage MuSo1, DNA transposition protein, putative  27.86 
 
 		 240 aa  46.6  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0480615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2069  prophage MuSo1, DNA transposition protein, putative  27.86 
 
 		 240 aa  46.6  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00213879  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3387  Type II secretory pathway  29.91 
 
 		 284 aa  42.4  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>