72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0215 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_0215  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 296 aa  604  9.999999999999999e-173  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.046425  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0412  putative phage DNA transposition protein  29.15 
 
 		 343 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00594514  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0786  DNA transposition protein  29.92 
 
 		 314 aa  100  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000808918  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0651  DNA transposition protein  29.92 
 
 		 314 aa  100  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00310883  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0269  bacteriophage DNA transposition protein B, putative  28.24 
 
 		 307 aa  99.8  5e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4524  B transposition domain-containing protein  27.06 
 
 		 319 aa  87.8  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2655  prophage MuSo2, DNA transposition protein, putative  28.21 
 
 		 318 aa  88.2  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4216  Putative ATPase, transposase-like protein  28.51 
 
 		 310 aa  86.3  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1664  DNA transposition protein (gpB)  26.67 
 
 		 324 aa  86.3  6e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3067  hypothetical protein  26.29 
 
 		 347 aa  67.8  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.462642  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4384  ATP-binding protein  26.57 
 
 		 270 aa  65.1  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1280  hypothetical protein  28.99 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2120  hypothetical protein  28.99 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1265  bacteriophage DNA transposition B protein, putative  28.57 
 
 		 233 aa  62  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.01342e-16 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1564  hypothetical protein  28.74 
 
 		 240 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370526 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3033  hypothetical protein  25.32 
 
 		 343 aa  60.1  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00438308  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0714  bacteriophage DNA transposition B protein  23.94 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0647  transposase protein B  28.21 
 
 		 256 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3367  transposase protein B  28.86 
 
 		 264 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0071  ATP-binding protein  27.5 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.721813  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0644  prophage MuSo1, DNA transposition protein, putative  28.5 
 
 		 239 aa  57.4  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1612  hypothetical protein  25.43 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.111767  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2069  prophage MuSo1, DNA transposition protein, putative  25.71 
 
 		 240 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00213879  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2116  prophage MuSo1, DNA transposition protein, putative  25.71 
 
 		 240 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0480615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0221  ATP-binding protein  26.5 
 
 		 270 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00123025 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0253  hypothetical protein  31.78 
 
 		 301 aa  54.3  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2827  general secretion pathway protein-related protein  30.77 
 
 		 274 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.088397  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4083  ATP-binding protein  23.48 
 
 		 274 aa  53.1  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.309906  normal  0.0721991 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3874  ATP-binding protein  23.48 
 
 		 274 aa  53.1  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.634834 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3678  ATP-binding protein  23.48 
 
 		 274 aa  53.1  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.478693 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0509  MSHA biogenesis protein MshM  27.93 
 
 		 302 aa  53.1  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2919  general secretion pathway protein-related protein  30.77 
 
 		 274 aa  53.1  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00976352  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0506  MSHA biogenesis protein MshM  27.93 
 
 		 302 aa  53.1  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3834  MSHA biogenesis protein MshM  27.93 
 
 		 302 aa  53.1  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.319406  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0485  MSHA biogenesis protein MshM  27.93 
 
 		 302 aa  53.1  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5447  AAA ATPase  29.8 
 
 		 271 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.739293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2821  potential ATP-binding protein  21.31 
 
 		 271 aa  52.8  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.804922  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2744  hypothetical protein  21.31 
 
 		 271 aa  52.8  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.795386  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1689  AAA ATPase  30.3 
 
 		 271 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0555  AAA ATPase  30.3 
 
 		 271 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2927  AAA ATPase  30.3 
 
 		 271 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.600702  normal  0.252794 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2502  AAA ATPase  30.3 
 
 		 271 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.747208 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0572  AAA ATPase  30.3 
 
 		 271 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4111  MSHA biogenesis protein MshM  27.93 
 
 		 310 aa  52  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0561  MSHA biogenesis protein MshM  27.93 
 
 		 308 aa  51.6  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5571  AAA ATPase  29.8 
 
 		 271 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.800357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1671  type II secretory pathway ATPase ExeA  27.54 
 
 		 505 aa  52  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000168756  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0346  ATP-binding protein  23.4 
 
 		 272 aa  51.6  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2908  bacteriophage DNA transposition B protein  26.92 
 
 		 250 aa  51.2  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00692562  normal  0.135602 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2735  general secretion pathway protein-related protein  30.37 
 
 		 274 aa  49.7  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.052626  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2954  prophage MuMc02, transposition protein B  28.35 
 
 		 223 aa  49.3  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2016  ATPase  25.75 
 
 		 338 aa  49.3  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0765  type II secretory pathway component ATPase  28.89 
 
 		 323 aa  48.9  0.00009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00521912  normal  0.0426164 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4120  bacteriophage DNA transposition B protein  26.37 
 
 		 250 aa  48.9  0.00009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000206213 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03091  putative ATPase and membrane protein  27.93 
 
 		 257 aa  48.5  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1989  AAA ATPase  26.9 
 
 		 268 aa  48.9  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001613  general secretion pathway protein A  33.33 
 
 		 538 aa  48.1  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3485  MSHA biogenesis protein MshM  27.03 
 
 		 310 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.607813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3346  MSHA biogenesis protein MshM  29.02 
 
 		 304 aa  47.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.158291  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0972  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.88 
 
 		 558 aa  47.4  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176108  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2967  AAA ATPase  30 
 
 		 308 aa  47.4  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3662  MSHA biogenesis protein MshM  27.03 
 
 		 309 aa  47.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0467  MSHA biogenesis protein MshM  27.03 
 
 		 309 aa  47.4  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3273  MSHA biogenesis protein MshM  32.93 
 
 		 300 aa  47  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3753  prophage MuSo1, DNA transposition protein, putative  25.29 
 
 		 241 aa  46.6  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00859  Type II secretory pathway, component ExeA  33.33 
 
 		 541 aa  46.2  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06218  hypothetical protein  25.44 
 
 		 326 aa  45.8  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1148  general secretion pathway protein A  31.13 
 
 		 563 aa  45.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.873243 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0977  AAA ATPase  28.76 
 
 		 498 aa  45.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0423306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3351  bacteriophage DNA transposition B protein, putative  26.57 
 
 		 234 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.382717  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3750  MSHA biogenesis protein MshM  27.19 
 
 		 314 aa  45.1  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.995764  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0171  MSHA biogenesis protein MshM  28.82 
 
 		 302 aa  42.4  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>