21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4384 on replicon NC_008537
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008537  Arth_4384  ATP-binding protein  100 
 
 
270 aa  557  1e-158  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0346  ATP-binding protein  64.34 
 
 
272 aa  366  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3678  ATP-binding protein  54.51 
 
 
274 aa  301  9e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.478693 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4083  ATP-binding protein  54.51 
 
 
274 aa  301  9e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.309906  normal  0.0721991 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3874  ATP-binding protein  54.51 
 
 
274 aa  301  9e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.634834 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0071  ATP-binding protein  49.26 
 
 
270 aa  249  4e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.721813  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0221  ATP-binding protein  49.26 
 
 
270 aa  247  2e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00123025 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2744  hypothetical protein  45.76 
 
 
271 aa  235  7e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.795386  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2821  potential ATP-binding protein  45.76 
 
 
271 aa  235  7e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.804922  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0269  bacteriophage DNA transposition protein B, putative  27.68 
 
 
307 aa  79.7  0.00000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0714  bacteriophage DNA transposition B protein  34.65 
 
 
260 aa  70.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0215  XRE family transcriptional regulator  26.57 
 
 
296 aa  65.1  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.046425  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3351  bacteriophage DNA transposition B protein, putative  26.15 
 
 
234 aa  52.8  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.382717  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2069  prophage MuSo1, DNA transposition protein, putative  24.78 
 
 
240 aa  52.4  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00213879  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2116  prophage MuSo1, DNA transposition protein, putative  24.78 
 
 
240 aa  52.4  0.000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0480615  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1151  hypothetical protein  22.13 
 
 
278 aa  51.6  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.275843 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2967  AAA ATPase  30.05 
 
 
308 aa  47.4  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0412  putative phage DNA transposition protein  26.5 
 
 
343 aa  45.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00594514  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2396  Type II secretory pathway component ExeA (predicted ATPase)-like protein  25.84 
 
 
427 aa  43.1  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3505  secretion ATPase  30.65 
 
 
831 aa  42.4  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000001058 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0835  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.43 
 
 
613 aa  42.4  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121118  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>