25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3033 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3033  hypothetical protein  100 
 
 		 343 aa  718    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00438308  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3067  hypothetical protein  89.05 
 
 		 347 aa  633  1e-180  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.462642  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4524  B transposition domain-containing protein  35.92 
 
 		 319 aa  172  6.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1664  DNA transposition protein (gpB)  29.51 
 
 		 324 aa  135  7.000000000000001e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2655  prophage MuSo2, DNA transposition protein, putative  28.25 
 
 		 318 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0651  DNA transposition protein  27.86 
 
 		 314 aa  94  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00310883  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0786  DNA transposition protein  27.86 
 
 		 314 aa  94  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000808918  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4216  Putative ATPase, transposase-like protein  24.4 
 
 		 310 aa  73.9  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0269  bacteriophage DNA transposition protein B, putative  26.67 
 
 		 307 aa  64.7  0.000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0215  XRE family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.046425  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0412  putative phage DNA transposition protein  22.47 
 
 		 343 aa  49.7  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00594514  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3750  MSHA biogenesis protein MshM  26.7 
 
 		 314 aa  47.8  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.995764  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1564  hypothetical protein  22.56 
 
 		 240 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370526 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3485  MSHA biogenesis protein MshM  25.35 
 
 		 310 aa  46.2  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.607813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0390  MSHA biogenesis protein MshM  25.91 
 
 		 301 aa  46.6  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1924  hypothetical protein  27.95 
 
 		 414 aa  46.2  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.42704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0467  MSHA biogenesis protein MshM  25.35 
 
 		 309 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3662  MSHA biogenesis protein MshM  25.35 
 
 		 309 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2821  MSHA biogenesis protein MshM  25 
 
 		 281 aa  45.4  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1587  peptidoglycan binding domain-containing protein  25.34 
 
 		 562 aa  44.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0587648  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002369  MSHA biogenesis protein MshM  25.77 
 
 		 261 aa  44.3  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0561  MSHA biogenesis protein MshM  24.73 
 
 		 308 aa  44.3  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4111  MSHA biogenesis protein MshM  26.44 
 
 		 310 aa  43.5  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3767  MSHA biogenesis protein MshM  25.86 
 
 		 302 aa  42.7  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0788  peptidoglycan binding domain-containing protein  25.3 
 
 		 568 aa  42.7  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>