25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2908 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_2908  bacteriophage DNA transposition B protein  100 
 
 		 250 aa  501  1e-141  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00692562  normal  0.135602 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4120  bacteriophage DNA transposition B protein  98.4 
 
 		 250 aa  494  1e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000206213 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0714  bacteriophage DNA transposition B protein  36.58 
 
 		 260 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3753  prophage MuSo1, DNA transposition protein, putative  29.46 
 
 		 241 aa  105  6e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0644  prophage MuSo1, DNA transposition protein, putative  29.29 
 
 		 239 aa  97.8  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2069  prophage MuSo1, DNA transposition protein, putative  31.86 
 
 		 240 aa  94  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00213879  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2116  prophage MuSo1, DNA transposition protein, putative  31.86 
 
 		 240 aa  94  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0480615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2381  AAA ATPase family protein  29.61 
 
 		 251 aa  84  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3351  bacteriophage DNA transposition B protein, putative  29.02 
 
 		 234 aa  72.8  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.382717  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2954  prophage MuMc02, transposition protein B  26.36 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1265  bacteriophage DNA transposition B protein, putative  28.44 
 
 		 233 aa  66.2  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.01342e-16 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1280  hypothetical protein  24.38 
 
 		 260 aa  65.9  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2120  hypothetical protein  24.38 
 
 		 260 aa  65.9  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0647  transposase protein B  26.89 
 
 		 256 aa  58.9  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1989  AAA ATPase  24.39 
 
 		 268 aa  52.4  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3367  transposase protein B  26.7 
 
 		 264 aa  52  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0215  XRE family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 296 aa  51.2  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.046425  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1895  Uncharacterized ATPase putative transposase  25.45 
 
 		 283 aa  50.8  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.292876  normal  0.903317 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1361  replication factor C large subunit  23.9 
 
 		 474 aa  44.7  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0412  putative phage DNA transposition protein  30.23 
 
 		 343 aa  44.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00594514  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2655  prophage MuSo2, DNA transposition protein, putative  25.56 
 
 		 318 aa  44.3  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0253  hypothetical protein  30.22 
 
 		 301 aa  42.7  0.005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4809  ATPase  29.32 
 
 		 460 aa  42.4  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0269  bacteriophage DNA transposition protein B, putative  26.97 
 
 		 307 aa  42.4  0.007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2645  SARP family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 819 aa  42  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.38915  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>