17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2645 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2645  SARP family transcriptional regulator  100 
 
 		 819 aa  1628    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.38915  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3683  transcriptional activator domain-containing protein  25.24 
 
 		 1034 aa  69.7  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00198659  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1630  SARP family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 1089 aa  62.4  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2154  transcriptional activator domain protein  40.34 
 
 		 1139 aa  61.6  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0522112 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  30.1 
 
 		 1022 aa  55.1  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4724  transcriptional activator domain-containing protein  34.84 
 
 		 713 aa  52.4  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0048  adenylate/guanylate cyclase  24.2 
 
 		 1142 aa  52  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0600  SARP family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 540 aa  52  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0330  SARP family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 202 aa  51.6  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.761582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  35.46 
 
 		 1029 aa  50.8  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  33.33 
 
 		 1055 aa  50.4  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2972  hypothetical protein  30.94 
 
 		 612 aa  50.4  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.322448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 998 aa  50.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7278  adenylate/guanylate cyclase  25.27 
 
 		 1094 aa  47  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.137597 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3701  SARP family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 1064 aa  46.2  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000037794 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0215  transcriptional activator domain protein  31.03 
 
 		 1163 aa  46.2  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.6802 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  30.77 
 
 		 900 aa  44.7  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>