70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0253 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0253  hypothetical protein  100 
 
 
301 aa  609  1e-173  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4216  Putative ATPase, transposase-like protein  25.31 
 
 
310 aa  65.5  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0269  bacteriophage DNA transposition protein B, putative  26.61 
 
 
307 aa  61.6  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3753  prophage MuSo1, DNA transposition protein, putative  32.8 
 
 
241 aa  61.6  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0215  XRE family transcriptional regulator  31.78 
 
 
296 aa  54.3  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.046425  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1503  peptidoglycan-binding LysM  34.75 
 
 
542 aa  55.1  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4524  B transposition domain-containing protein  30.56 
 
 
319 aa  53.9  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3404  ATPas  31.3 
 
 
459 aa  53.5  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0765  type II secretory pathway component ATPase  28.42 
 
 
323 aa  53.1  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00521912  normal  0.0426164 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1280  hypothetical protein  30.57 
 
 
260 aa  52.8  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2120  hypothetical protein  30.57 
 
 
260 aa  52.8  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00859  Type II secretory pathway, component ExeA  32.65 
 
 
541 aa  52.4  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1148  general secretion pathway protein A  28.29 
 
 
563 aa  51.6  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.873243 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0471  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.43 
 
 
580 aa  49.7  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.194095 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1664  DNA transposition protein (gpB)  26.01 
 
 
324 aa  50.1  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0462  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.43 
 
 
577 aa  50.1  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.388723  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0972  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.12 
 
 
558 aa  49.3  0.00009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176108  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1766  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.97 
 
 
564 aa  48.5  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1265  bacteriophage DNA transposition B protein, putative  23.93 
 
 
233 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.01342e-16 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0788  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.82 
 
 
568 aa  47.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2069  prophage MuSo1, DNA transposition protein, putative  31.2 
 
 
240 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00213879  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0644  prophage MuSo1, DNA transposition protein, putative  31.01 
 
 
239 aa  47.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0977  AAA ATPase  28.47 
 
 
498 aa  47.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0423306  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4575  MSHA biogenesis protein MshM  29.94 
 
 
300 aa  48.1  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4212  putative general secretion pathway protein A  30.71 
 
 
563 aa  48.5  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2116  prophage MuSo1, DNA transposition protein, putative  31.2 
 
 
240 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0480615  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0061  general secretion pathway protein A  29.22 
 
 
549 aa  47  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71374  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2879  AAA ATPase  30.71 
 
 
422 aa  46.6  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1030  general secretion pathway protein A  29.51 
 
 
320 aa  46.6  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00881191 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1587  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.01 
 
 
562 aa  46.6  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0587648  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2655  prophage MuSo2, DNA transposition protein, putative  31.53 
 
 
318 aa  46.2  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2300  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.92 
 
 
532 aa  45.4  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0976  TniB family protein  27.27 
 
 
276 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.104789 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00370  conjugative relaxase domain protein, TrwC/TraI family  30.17 
 
 
1174 aa  45.4  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3190  AAA ATPase  29.66 
 
 
388 aa  45.4  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06440  TrwC relaxase  31.03 
 
 
1184 aa  45.8  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001613  general secretion pathway protein A  30.61 
 
 
538 aa  45.4  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0835  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.33 
 
 
613 aa  45.4  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121118  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2954  prophage MuMc02, transposition protein B  27.63 
 
 
223 aa  45.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4035  AAA ATPase  29.49 
 
 
532 aa  44.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.267259  normal  0.70324 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2499  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.14 
 
 
562 aa  45.1  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000546942 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1982  general secretion pathway protein-related protein  33.58 
 
 
393 aa  43.9  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2466  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.99 
 
 
562 aa  44.3  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0075  general secretion pathway protein, ATPase  29.25 
 
 
447 aa  44.3  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.897971  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0647  transposase protein B  31.54 
 
 
256 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3750  MSHA biogenesis protein MshM  25.64 
 
 
314 aa  44.3  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.995764  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5447  AAA ATPase  30.94 
 
 
271 aa  43.5  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.739293  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0637  ATPase  27.53 
 
 
368 aa  43.9  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0412  putative phage DNA transposition protein  28.44 
 
 
343 aa  43.9  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00594514  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2983  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.33 
 
 
557 aa  43.5  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1031  general secretion pathway protein A  28.17 
 
 
563 aa  43.1  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184007  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3505  secretion ATPase  27.78 
 
 
831 aa  43.1  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000001058 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1071  AAA ATPase  28.81 
 
 
388 aa  43.1  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.618974  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2981  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.79 
 
 
589 aa  43.1  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0901758 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2023  general secretion pathway protein A  27.4 
 
 
529 aa  43.1  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000142113  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2908  bacteriophage DNA transposition B protein  30.22 
 
 
250 aa  42.7  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00692562  normal  0.135602 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0572  AAA ATPase  30.94 
 
 
271 aa  42.7  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1009  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.57 
 
 
587 aa  42.7  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00166085  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4120  bacteriophage DNA transposition B protein  30.15 
 
 
250 aa  42.7  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000206213 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3331  general secretion pathway protein, ATPase  28.77 
 
 
310 aa  42.7  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0818579  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2927  AAA ATPase  30.94 
 
 
271 aa  42.7  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.600702  normal  0.252794 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2502  AAA ATPase  30.94 
 
 
271 aa  42.7  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.747208 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1689  AAA ATPase  30.94 
 
 
271 aa  42.7  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0555  AAA ATPase  30.94 
 
 
271 aa  42.7  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2822  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.15 
 
 
556 aa  42.7  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.786314  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3273  MSHA biogenesis protein MshM  28.47 
 
 
300 aa  42.7  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1564  hypothetical protein  27.34 
 
 
240 aa  42.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00370526 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1116  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.69 
 
 
559 aa  42.4  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2200  uncharacterized ATPase putative transposase  28.29 
 
 
276 aa  42.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.866593  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3128  uncharacterized ATPase putative transposase  28.29 
 
 
276 aa  42.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.765042 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>