19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0651 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0651  DNA transposition protein  100 
 
 		 314 aa  644    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00310883  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0786  DNA transposition protein  100 
 
 		 314 aa  644    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000808918  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2655  prophage MuSo2, DNA transposition protein, putative  65.41 
 
 		 318 aa  436  1e-121  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1664  DNA transposition protein (gpB)  36.45 
 
 		 324 aa  205  9e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4524  B transposition domain-containing protein  35.31 
 
 		 319 aa  168  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3067  hypothetical protein  28.42 
 
 		 347 aa  110  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.462642  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3033  hypothetical protein  27.86 
 
 		 343 aa  105  8e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00438308  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0215  XRE family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 296 aa  102  9e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.046425  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4216  Putative ATPase, transposase-like protein  28.97 
 
 		 310 aa  94.7  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0269  bacteriophage DNA transposition protein B, putative  27.86 
 
 		 307 aa  79.7  0.00000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0412  putative phage DNA transposition protein  25.55 
 
 		 343 aa  63.5  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00594514  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1564  hypothetical protein  26.53 
 
 		 240 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370526 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0099  hypothetical protein  23.35 
 
 		 256 aa  50.1  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.253921 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3351  bacteriophage DNA transposition B protein, putative  30.33 
 
 		 234 aa  49.3  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.382717  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0144  AAA ATPase  27.57 
 
 		 349 aa  46.2  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1071  AAA ATPase  29.58 
 
 		 388 aa  45.8  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.618974  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1265  bacteriophage DNA transposition B protein, putative  26.97 
 
 		 233 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.01342e-16 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3190  AAA ATPase  30.28 
 
 		 388 aa  45.8  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1895  Uncharacterized ATPase putative transposase  27.56 
 
 		 283 aa  45.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.292876  normal  0.903317 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>