27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2537 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2537  hypothetical protein  100 
 
 		 357 aa  733    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2089  hypothetical protein  48.46 
 
 		 356 aa  344  1e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.705545  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4753  hypothetical protein  30 
 
 		 362 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.713653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1191  hypothetical protein  30.11 
 
 		 360 aa  149  8e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.360299  normal  0.2185 
 
 
-
 
NC_004310  BR0730  transposition protein, putative  31.15 
 
 		 316 aa  124  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.12407  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0459  transposition protein, putative  29.49 
 
 		 332 aa  124  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.204246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0726  putative transposition protein  31.88 
 
 		 256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1518  hypothetical protein  27.22 
 
 		 351 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.558401  normal  0.288847 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3202  transposition protein, putative  25.88 
 
 		 342 aa  99.8  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1427  hypothetical protein  28.14 
 
 		 345 aa  97.4  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0026  hypothetical protein  31.18 
 
 		 379 aa  92.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3213  hypothetical protein  24.13 
 
 		 317 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2234  AAA ATPase  23.85 
 
 		 304 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.389055  decreased coverage  0.000860852 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0016  AAA ATPase  26.38 
 
 		 312 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1591  TniB  26.14 
 
 		 313 aa  49.3  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.545721  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0694  TniB  26.14 
 
 		 313 aa  49.3  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2603  AAA ATPase  27.22 
 
 		 377 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0342788  normal  0.397066 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4741  AAA ATPase  29.94 
 
 		 335 aa  45.4  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6544  hypothetical protein  23.41 
 
 		 302 aa  45.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4716  AAA ATPase  27.83 
 
 		 344 aa  45.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0132435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1681  TniB family protein  27.21 
 
 		 301 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.844069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2935  TniB family protein  27.21 
 
 		 301 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.734369  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2523  TniB family protein  26.53 
 
 		 301 aa  43.5  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.122196 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0644  prophage MuSo1, DNA transposition protein, putative  27.72 
 
 		 239 aa  43.5  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1579  TniB family protein  24.66 
 
 		 301 aa  43.5  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0154252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4979  TniB family protein  25.85 
 
 		 301 aa  43.1  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635243 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3185  AAA ATPase  26.54 
 
 		 338 aa  42.7  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.820352  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>