16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1427 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1427  hypothetical protein  100 
 
 		 345 aa  716    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3213  hypothetical protein  30.13 
 
 		 317 aa  159  9e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0730  transposition protein, putative  30.54 
 
 		 316 aa  124  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.12407  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0726  putative transposition protein  30.47 
 
 		 256 aa  101  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2537  hypothetical protein  28.14 
 
 		 357 aa  97.4  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3202  transposition protein, putative  29.37 
 
 		 342 aa  91.3  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0459  transposition protein, putative  24.67 
 
 		 332 aa  86.7  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.204246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1191  hypothetical protein  26.64 
 
 		 360 aa  82.8  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.360299  normal  0.2185 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2089  hypothetical protein  24.45 
 
 		 356 aa  82.4  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.705545  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4753  hypothetical protein  26.95 
 
 		 362 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.713653  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1518  hypothetical protein  24.81 
 
 		 351 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.558401  normal  0.288847 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0017  hypothetical protein  28.66 
 
 		 335 aa  58.5  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2351  hypothetical protein  26.86 
 
 		 310 aa  55.8  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0363942 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6544  hypothetical protein  23.77 
 
 		 302 aa  46.2  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2234  AAA ATPase  22.49 
 
 		 304 aa  43.1  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.389055  decreased coverage  0.000860852 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0376  hypothetical protein  25 
 
 		 330 aa  42.7  0.01  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>