47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0376 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0376  hypothetical protein  100 
 
 		 330 aa  672    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06218  hypothetical protein  26.37 
 
 		 326 aa  127  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0016  AAA ATPase  28.97 
 
 		 312 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4199  hypothetical protein  25.86 
 
 		 340 aa  94.4  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3861  hypothetical protein  26.43 
 
 		 319 aa  94.4  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0197504 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6544  hypothetical protein  25.43 
 
 		 302 aa  89  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2234  AAA ATPase  27.57 
 
 		 304 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.389055  decreased coverage  0.000860852 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0017  hypothetical protein  26.5 
 
 		 335 aa  76.6  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0015  AAA ATPase  25.41 
 
 		 319 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000241771 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0007  AAA ATPase  25.41 
 
 		 319 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00746213  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0009  AAA ATPase  25.41 
 
 		 319 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0992238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0007  AAA ATPase  25.41 
 
 		 319 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0029  transposition helper protein  25 
 
 		 311 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1630  hypothetical protein  22.93 
 
 		 313 aa  60.8  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1646  TniB  23.58 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4580  TniB  24.07 
 
 		 307 aa  55.8  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2351  hypothetical protein  22.89 
 
 		 310 aa  55.8  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0363942 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2176  hypothetical protein  28.3 
 
 		 316 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.476118  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0203  TniB family protein  24.76 
 
 		 296 aa  53.9  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000461538 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1703  hypothetical protein  22.54 
 
 		 322 aa  50.1  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06977  hypothetical protein  27.4 
 
 		 196 aa  50.1  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0459  transposition protein, putative  26.38 
 
 		 332 aa  49.7  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.204246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4287  TniB  21.28 
 
 		 440 aa  49.7  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.105258  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2504  transposon transposition helper protein C, putative  21.88 
 
 		 294 aa  48.9  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.059168  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0247  AAA ATPase  25.57 
 
 		 562 aa  48.9  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.472515 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0124  putative NTP-binding protein TniB  22.46 
 
 		 298 aa  48.5  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5057  hypothetical protein  23.03 
 
 		 312 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.847367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5217  hypothetical protein  23.03 
 
 		 312 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.736835  normal  0.213042 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4603  TniB  23.17 
 
 		 293 aa  48.1  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.956661  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4383  TniB  23.17 
 
 		 293 aa  48.1  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0720685  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4305  TniB  23.17 
 
 		 293 aa  48.1  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.893182  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4221  TniB  23.17 
 
 		 293 aa  48.1  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341366  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3151  hypothetical protein  23.03 
 
 		 312 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1518  hypothetical protein  25 
 
 		 351 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.558401  normal  0.288847 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0176  Tn7-like transposition protein C  25.53 
 
 		 550 aa  47  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2266  hypothetical protein  22.18 
 
 		 315 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.339393 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0144  Tn7-like transposition protein C  22.87 
 
 		 559 aa  46.2  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.23135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0697  general secretion pathway protein-related protein  22.82 
 
 		 298 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4721  AAA ATPase  20.89 
 
 		 327 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.895386  normal  0.068339 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6941  hypothetical protein  27.03 
 
 		 470 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0945854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2603  AAA ATPase  20.78 
 
 		 377 aa  43.9  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0342788  normal  0.397066 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1191  hypothetical protein  28.91 
 
 		 360 aa  43.9  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.360299  normal  0.2185 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3826  transposon Tn7 transposition protein TnsC  24.84 
 
 		 545 aa  43.9  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109282 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1203  Tn5468, transposition protein C  23.78 
 
 		 552 aa  43.1  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3934  AAA ATPase  22.73 
 
 		 546 aa  43.1  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1427  hypothetical protein  25 
 
 		 345 aa  42.7  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3578  TniB family protein  19.23 
 
 		 308 aa  42.7  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0550246  normal  0.0268044 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>