27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0459 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0459  transposition protein, putative  100 
 
 		 332 aa  673    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.204246  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0730  transposition protein, putative  37.5 
 
 		 316 aa  189  7e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.12407  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0726  putative transposition protein  36.32 
 
 		 256 aa  139  1e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2537  hypothetical protein  29.49 
 
 		 357 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3213  hypothetical protein  30.63 
 
 		 317 aa  123  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2089  hypothetical protein  28.72 
 
 		 356 aa  112  7.000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.705545  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1191  hypothetical protein  32.38 
 
 		 360 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.360299  normal  0.2185 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4753  hypothetical protein  29.43 
 
 		 362 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.713653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3202  transposition protein, putative  30.74 
 
 		 342 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2234  AAA ATPase  28.24 
 
 		 304 aa  87.8  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.389055  decreased coverage  0.000860852 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1427  hypothetical protein  24.67 
 
 		 345 aa  86.7  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1518  hypothetical protein  24.18 
 
 		 351 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.558401  normal  0.288847 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6544  hypothetical protein  28.04 
 
 		 302 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0026  hypothetical protein  25 
 
 		 379 aa  69.7  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0376  hypothetical protein  26.38 
 
 		 330 aa  49.7  0.00006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0203  TniB family protein  25.8 
 
 		 296 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000461538 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1703  hypothetical protein  28.57 
 
 		 322 aa  46.6  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2603  AAA ATPase  22.89 
 
 		 377 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0342788  normal  0.397066 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0686  general secretion pathway protein-related protein  24.77 
 
 		 306 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.731417  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0687  general secretion pathway protein-related protein  24.77 
 
 		 306 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0007  AAA ATPase  23.79 
 
 		 319 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00746213  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0015  AAA ATPase  23.79 
 
 		 319 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000241771 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0009  AAA ATPase  23.79 
 
 		 319 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0992238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0007  AAA ATPase  23.79 
 
 		 319 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0057  transposition helper protein  27.93 
 
 		 296 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0652  general secretion pathway protein-related protein  24.77 
 
 		 305 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.116587  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0407  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.27 
 
 		 389 aa  43.5  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>