15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3213 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3213  hypothetical protein  100 
 
 		 317 aa  660    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1427  hypothetical protein  30.13 
 
 		 345 aa  159  8e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0459  transposition protein, putative  30.63 
 
 		 332 aa  123  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.204246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4753  hypothetical protein  28.03 
 
 		 362 aa  108  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.713653  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0730  transposition protein, putative  27.24 
 
 		 316 aa  106  4e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.12407  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1191  hypothetical protein  26.39 
 
 		 360 aa  97.8  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.360299  normal  0.2185 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2089  hypothetical protein  26.24 
 
 		 356 aa  95.5  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.705545  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0726  putative transposition protein  28.77 
 
 		 256 aa  95.1  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1518  hypothetical protein  24.56 
 
 		 351 aa  83.6  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.558401  normal  0.288847 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2537  hypothetical protein  24.13 
 
 		 357 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3202  transposition protein, putative  26.03 
 
 		 342 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2234  AAA ATPase  30.72 
 
 		 304 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.389055  decreased coverage  0.000860852 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0026  hypothetical protein  26.92 
 
 		 379 aa  70.5  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6544  hypothetical protein  25.11 
 
 		 302 aa  51.2  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2351  hypothetical protein  24.57 
 
 		 310 aa  47.4  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0363942 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>