18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3202 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3202  transposition protein, putative  100 
 
 		 342 aa  693    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0730  transposition protein, putative  32.43 
 
 		 316 aa  118  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.12407  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0459  transposition protein, putative  29.5 
 
 		 332 aa  105  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.204246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2537  hypothetical protein  25.88 
 
 		 357 aa  99.8  7e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0726  putative transposition protein  31.12 
 
 		 256 aa  99.8  7e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4753  hypothetical protein  29.59 
 
 		 362 aa  99  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.713653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1427  hypothetical protein  29.37 
 
 		 345 aa  91.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1191  hypothetical protein  26.71 
 
 		 360 aa  89.4  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.360299  normal  0.2185 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2089  hypothetical protein  24.16 
 
 		 356 aa  84.3  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.705545  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1518  hypothetical protein  26.27 
 
 		 351 aa  83.6  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.558401  normal  0.288847 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3213  hypothetical protein  26.03 
 
 		 317 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0026  hypothetical protein  22.32 
 
 		 379 aa  59.7  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2234  AAA ATPase  27.81 
 
 		 304 aa  49.7  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.389055  decreased coverage  0.000860852 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0382  AAA ATPase  30.37 
 
 		 266 aa  46.2  0.0009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0545  AAA ATPase  30.37 
 
 		 266 aa  46.2  0.0009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1106  AAA ATPase  30.37 
 
 		 266 aa  46.2  0.0009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.597508  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1329  AAA ATPase  30.37 
 
 		 266 aa  46.2  0.0009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1875  AAA ATPase  30.37 
 
 		 266 aa  46.2  0.0009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.871076  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>