20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1191 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1191  hypothetical protein  100 
 
 		 360 aa  746    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.360299  normal  0.2185 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2537  hypothetical protein  30.11 
 
 		 357 aa  149  8e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0730  transposition protein, putative  32.94 
 
 		 316 aa  137  3.0000000000000003e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.12407  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2089  hypothetical protein  28.23 
 
 		 356 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.705545  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0726  putative transposition protein  32.74 
 
 		 256 aa  123  4e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0459  transposition protein, putative  32.38 
 
 		 332 aa  111  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.204246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3213  hypothetical protein  26.39 
 
 		 317 aa  97.8  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1518  hypothetical protein  24.3 
 
 		 351 aa  95.9  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.558401  normal  0.288847 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4753  hypothetical protein  25.3 
 
 		 362 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.713653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3202  transposition protein, putative  26.71 
 
 		 342 aa  89  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1427  hypothetical protein  26.64 
 
 		 345 aa  82.8  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0026  hypothetical protein  23.51 
 
 		 379 aa  82.8  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2603  AAA ATPase  24.28 
 
 		 377 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0342788  normal  0.397066 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1591  TniB  23.95 
 
 		 313 aa  52.4  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.545721  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0694  TniB  23.95 
 
 		 313 aa  52.4  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0017  hypothetical protein  27.53 
 
 		 335 aa  48.1  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0016  AAA ATPase  30.46 
 
 		 312 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6544  hypothetical protein  25.55 
 
 		 302 aa  44.3  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0376  hypothetical protein  28.91 
 
 		 330 aa  43.9  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0203  TniB family protein  28.67 
 
 		 296 aa  43.9  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000461538 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>