74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0694 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1591  TniB  100 
 
 		 313 aa  635    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.545721  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0694  TniB  100 
 
 		 313 aa  635    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0124  putative NTP-binding protein TniB  36.84 
 
 		 298 aa  197  3e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1646  TniB  34.72 
 
 		 300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3578  TniB family protein  33.45 
 
 		 308 aa  181  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0550246  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3048  TniB  33.67 
 
 		 303 aa  176  5e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.37719 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4973  NTP-binding protein TniB  31.19 
 
 		 302 aa  165  8e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899984  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4044  NTP-binding protein TniB  31.19 
 
 		 302 aa  165  8e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160827  normal  0.440608 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3009  hypothetical protein  31.19 
 
 		 302 aa  165  8e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00246617 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0157  transposition protein TniB  32.84 
 
 		 286 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2647  TniB family protein  33.45 
 
 		 298 aa  161  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.288166  normal  0.0374868 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2172  TniB family protein  33.45 
 
 		 298 aa  161  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.248869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1347  TniB family protein  33.45 
 
 		 298 aa  161  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0057  transposition helper protein  32.07 
 
 		 296 aa  161  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1223  TniB family protein  33.45 
 
 		 298 aa  161  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.985075  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0203  TniB family protein  31.9 
 
 		 296 aa  155  6e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000461538 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2504  transposon transposition helper protein C, putative  30.6 
 
 		 294 aa  154  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.059168  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1174  transposition protein TniB  32.81 
 
 		 302 aa  152  7e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2523  TniB family protein  31.08 
 
 		 301 aa  149  7e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.122196 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2935  TniB family protein  31.27 
 
 		 301 aa  149  8e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.734369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1681  TniB family protein  31.27 
 
 		 301 aa  149  8e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.844069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0188  urease, alpha subunit  28.57 
 
 		 293 aa  148  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4979  TniB family protein  31.08 
 
 		 301 aa  146  5e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635243 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5461  TniB family protein  30.25 
 
 		 297 aa  144  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.93146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1579  TniB family protein  31.71 
 
 		 301 aa  144  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0154252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6596  TniB family protein  29.89 
 
 		 289 aa  142  5e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0219  TniB family protein  32.09 
 
 		 325 aa  142  8e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.858856  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3259  TniB family protein  29.18 
 
 		 289 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.112641 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4904  TniB  29.18 
 
 		 289 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4235  hypothetical protein  30.72 
 
 		 292 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.814526 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6260  TniB  27.42 
 
 		 289 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4383  TniB  30.29 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0720685  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4305  TniB  30.29 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.893182  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4603  TniB  30.29 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.956661  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4221  TniB  30.29 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341366  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4686  TniB family protein  28.22 
 
 		 301 aa  125  7e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.60041  normal  0.0211663 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4580  TniB  27.27 
 
 		 307 aa  125  8.000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4393  TniB  26.62 
 
 		 292 aa  116  5e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2132  TniB family protein  30.88 
 
 		 203 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.521965  normal  0.0287257 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3006  TniB  28.45 
 
 		 497 aa  100  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.270037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4287  TniB  28.07 
 
 		 440 aa  93.6  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.105258  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4507  TniB  25.64 
 
 		 296 aa  92.4  9e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5454  TniB  32.87 
 
 		 167 aa  91.7  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.487668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0016  AAA ATPase  26.37 
 
 		 312 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5455  hypothetical protein  31.97 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.201732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6544  hypothetical protein  20.88 
 
 		 302 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0976  TniB family protein  23.08 
 
 		 276 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.104789 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2603  AAA ATPase  26.53 
 
 		 377 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0342788  normal  0.397066 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1151  hypothetical protein  23.37 
 
 		 278 aa  59.3  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.275843 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2200  uncharacterized ATPase putative transposase  22.99 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.866593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3128  uncharacterized ATPase putative transposase  22.99 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.765042 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06218  hypothetical protein  20.77 
 
 		 326 aa  55.1  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4753  hypothetical protein  22.75 
 
 		 362 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.713653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1191  hypothetical protein  23.95 
 
 		 360 aa  52.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.360299  normal  0.2185 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2982  TniB family protein  23.65 
 
 		 290 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2266  hypothetical protein  25 
 
 		 315 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.339393 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3040  TniB  30 
 
 		 98 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0015  AAA ATPase  22.96 
 
 		 319 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000241771 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0007  AAA ATPase  22.96 
 
 		 319 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0009  AAA ATPase  22.96 
 
 		 319 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0992238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0007  AAA ATPase  22.96 
 
 		 319 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00746213  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2537  hypothetical protein  26.14 
 
 		 357 aa  49.3  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3219  ATP/GTP-binding protein  20.92 
 
 		 342 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.184147  normal  0.517488 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3182  putative ATP/GTP-binding protein  22.55 
 
 		 337 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0612  ATP/GTP-binding protein  22.55 
 
 		 337 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.775808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4322  hypothetical protein  21.76 
 
 		 478 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5057  hypothetical protein  21.33 
 
 		 312 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.847367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5217  hypothetical protein  21.33 
 
 		 312 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.736835  normal  0.213042 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3151  hypothetical protein  21.33 
 
 		 312 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6967  Tn7-like transposition protein C  20.78 
 
 		 540 aa  46.6  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.827899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1341  hypothetical protein  26.57 
 
 		 268 aa  43.9  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.720259  normal  0.280158 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4358  transposon Tn7 transposition protein TnsC  25.43 
 
 		 552 aa  43.5  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0730  transposition protein, putative  23.08 
 
 		 316 aa  42.7  0.008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.12407  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4716  hypothetical protein  25 
 
 		 354 aa  42.7  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>