More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2603 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2603  AAA ATPase  100 
 
 		 377 aa  764    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0342788  normal  0.397066 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6544  hypothetical protein  30.66 
 
 		 302 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06218  hypothetical protein  29.2 
 
 		 326 aa  103  5e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0016  AAA ATPase  29.25 
 
 		 312 aa  96.7  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0015  AAA ATPase  28.52 
 
 		 319 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000241771 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0007  AAA ATPase  28.52 
 
 		 319 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00746213  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0007  AAA ATPase  28.52 
 
 		 319 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0009  AAA ATPase  28.52 
 
 		 319 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0992238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1646  TniB  31.38 
 
 		 300 aa  89.7  8e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0017  hypothetical protein  28.06 
 
 		 335 aa  82.8  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5057  hypothetical protein  28.21 
 
 		 312 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.847367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0188  urease, alpha subunit  26.97 
 
 		 293 aa  77.8  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3151  hypothetical protein  27.84 
 
 		 312 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5217  hypothetical protein  27.84 
 
 		 312 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.736835  normal  0.213042 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2234  AAA ATPase  24.64 
 
 		 304 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.389055  decreased coverage  0.000860852 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0124  putative NTP-binding protein TniB  28.77 
 
 		 298 aa  66.6  0.0000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0694  TniB  26.53 
 
 		 313 aa  63.5  0.000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1591  TniB  26.53 
 
 		 313 aa  63.5  0.000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.545721  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1630  hypothetical protein  24.07 
 
 		 313 aa  62.4  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2351  hypothetical protein  23.64 
 
 		 310 aa  61.2  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0363942 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0057  transposition helper protein  24.9 
 
 		 296 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6260  TniB  27.66 
 
 		 289 aa  56.2  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0026  hypothetical protein  24.9 
 
 		 379 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4576  AAA ATPase  27.27 
 
 		 345 aa  55.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3503  AAA ATPase  27.27 
 
 		 345 aa  55.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2523  TniB family protein  28.87 
 
 		 301 aa  55.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.122196 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3009  hypothetical protein  27.91 
 
 		 302 aa  55.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00246617 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4044  NTP-binding protein TniB  27.91 
 
 		 302 aa  55.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160827  normal  0.440608 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4973  NTP-binding protein TniB  27.91 
 
 		 302 aa  55.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899984  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1191  hypothetical protein  24.28 
 
 		 360 aa  55.1  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.360299  normal  0.2185 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0203  TniB family protein  25.21 
 
 		 296 aa  54.7  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000461538 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1579  TniB family protein  28.63 
 
 		 301 aa  53.9  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0154252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2935  TniB family protein  28.45 
 
 		 301 aa  53.1  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.734369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1681  TniB family protein  28.45 
 
 		 301 aa  53.1  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.844069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0543  hypothetical protein  25.68 
 
 		 319 aa  52  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0157  transposition protein TniB  26.84 
 
 		 286 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4979  TniB family protein  28.87 
 
 		 301 aa  52.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635243 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2504  transposon transposition helper protein C, putative  24.9 
 
 		 294 aa  51.6  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.059168  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2266  hypothetical protein  22.6 
 
 		 315 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.339393 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1174  transposition protein TniB  28.1 
 
 		 302 aa  51.2  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2208  ATP-dependent chaperone ClpB  30.98 
 
 		 863 aa  51.2  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.250502 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0887  ATP-dependent chaperone ClpB  30.05 
 
 		 854 aa  50.8  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.763856  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3813  ATP-dependent chaperone ClpB  32.97 
 
 		 866 aa  50.8  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.162309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3521  ATP-dependent chaperone ClpB  32.97 
 
 		 866 aa  50.8  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0824402  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3404  ATPase AAA-2 domain protein  31.87 
 
 		 843 aa  50.4  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4904  TniB  25.65 
 
 		 289 aa  50.4  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3259  TniB family protein  25.65 
 
 		 289 aa  50.4  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.112641 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02310  chaperone, putative  29.41 
 
 		 834 aa  50.1  0.00006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4721  AAA ATPase  25.2 
 
 		 327 aa  50.1  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.895386  normal  0.068339 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0449  ATPase AAA-2 domain protein  31.25 
 
 		 842 aa  50.1  0.00006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.673117 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0363  ATPase AAA-2 domain protein  30.63 
 
 		 852 aa  50.1  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35440  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  31.25 
 
 		 851 aa  50.1  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0199  ATP-dependent Clp protease, subunit B  31.62 
 
 		 856 aa  50.1  0.00007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5085  ATP-dependent chaperone ClpB  31.58 
 
 		 878 aa  49.7  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0062  ATPase  31.88 
 
 		 875 aa  50.1  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.294718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0466  ATPase  32.5 
 
 		 861 aa  50.1  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3164  ATPase  30.15 
 
 		 857 aa  50.1  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.311114  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0190  ATPase  31.25 
 
 		 834 aa  49.7  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.362734 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1007  ATPase  34.53 
 
 		 862 aa  49.7  0.00008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.783787 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3055  ATPase AAA-2 domain protein  30.63 
 
 		 858 aa  49.7  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0115492 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0220  ATPase  32.5 
 
 		 839 aa  49.7  0.00008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230139  normal  0.171327 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5193  Tn7-like transposition protein C  22.13 
 
 		 467 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4716  AAA ATPase  24.49 
 
 		 344 aa  49.7  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0132435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1480  ATPase AAA-2 domain protein  29.38 
 
 		 823 aa  48.9  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0038131  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8371  ATPase AAA-2 domain protein  31.25 
 
 		 850 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0730  transposition protein, putative  25 
 
 		 316 aa  49.3  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.12407  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5381  ATP-dependent chaperone ClpB  31.58 
 
 		 878 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3577  clpB protein  30.88 
 
 		 857 aa  48.9  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4992  ATPase AAA-2 domain protein  31.25 
 
 		 836 aa  49.7  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.384287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4383  ATPase AAA-2  30.63 
 
 		 834 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.388012 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01540  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  31.87 
 
 		 851 aa  49.3  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1289  ATPase AAA-2  30.48 
 
 		 865 aa  49.3  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00235636  normal  0.153454 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4475  ATPase AAA-2 domain protein  31.25 
 
 		 837 aa  49.3  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2948  ATPase  30.15 
 
 		 857 aa  49.3  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0510097 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2996  ATPase AAA-2  33.15 
 
 		 891 aa  49.3  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05080  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  30 
 
 		 858 aa  48.9  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3416  ATPase AAA-2 domain-containing protein  31.25 
 
 		 834 aa  48.9  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1483  peptidoglycan binding domain-containing protein  26.72 
 
 		 536 aa  49.3  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2603  clpB protein  30.88 
 
 		 857 aa  49.3  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0399134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0641  ATPase AAA-2 domain protein  31.25 
 
 		 841 aa  49.3  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2346  ATP-dependent chaperone ClpB  30.43 
 
 		 874 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.325239 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06061  ATP-dependent Clp protease, Hsp 100, ATP-binding subunit ClpB  34.53 
 
 		 860 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2015  ClpB  29.41 
 
 		 859 aa  48.5  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6596  TniB family protein  25 
 
 		 289 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0132  ATPase  34.53 
 
 		 873 aa  48.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5207  ATP-dependent chaperone ClpB  33.33 
 
 		 870 aa  48.5  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0911  ATPase  33.81 
 
 		 862 aa  48.1  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.629487  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1089  ATPase  33.09 
 
 		 883 aa  48.9  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000277828 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2232  ATPase  30.15 
 
 		 870 aa  48.5  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4335  ATPase AAA-2 domain protein  31.87 
 
 		 840 aa  48.5  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0595  ATPase AAA-2 domain protein  31.25 
 
 		 851 aa  48.1  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.190948  normal  0.0636488 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13030  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  30.52 
 
 		 879 aa  48.1  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0171216  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3578  TniB family protein  25.88 
 
 		 308 aa  48.5  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0550246  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2309  ATP-dependent chaperone ClpB  34.53 
 
 		 872 aa  48.1  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4275  ATPase  30.63 
 
 		 844 aa  48.5  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.219573 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4709  ATPase  30.63 
 
 		 844 aa  48.1  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0549246  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2991  ATPase  30.88 
 
 		 857 aa  48.9  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00302942  normal  0.61786 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3072  ATPase  30.88 
 
 		 857 aa  48.9  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0239882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1195  chaperone  31.28 
 
 		 879 aa  48.9  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.1218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0571  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  28.64 
 
 		 684 aa  48.5  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>