25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2089 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2089  hypothetical protein  100 
 
 		 356 aa  735    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.705545  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2537  hypothetical protein  48.46 
 
 		 357 aa  344  1e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4753  hypothetical protein  29.36 
 
 		 362 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.713653  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0730  transposition protein, putative  33.69 
 
 		 316 aa  138  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.12407  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1191  hypothetical protein  28.23 
 
 		 360 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.360299  normal  0.2185 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0726  putative transposition protein  34.96 
 
 		 256 aa  125  8.000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0459  transposition protein, putative  28.72 
 
 		 332 aa  112  7.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.204246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0026  hypothetical protein  27.34 
 
 		 379 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1518  hypothetical protein  24.09 
 
 		 351 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.558401  normal  0.288847 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3213  hypothetical protein  26.24 
 
 		 317 aa  95.5  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3202  transposition protein, putative  24.16 
 
 		 342 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1427  hypothetical protein  24.45 
 
 		 345 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2234  AAA ATPase  23.05 
 
 		 304 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.389055  decreased coverage  0.000860852 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2523  TniB family protein  23.58 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.122196 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6544  hypothetical protein  27.02 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1579  TniB family protein  22.03 
 
 		 301 aa  57  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0154252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4979  TniB family protein  21.83 
 
 		 301 aa  56.6  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635243 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1681  TniB family protein  23.32 
 
 		 301 aa  56.6  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.844069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2935  TniB family protein  23.32 
 
 		 301 aa  56.6  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.734369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2603  AAA ATPase  25.16 
 
 		 377 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0342788  normal  0.397066 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4322  hypothetical protein  22.45 
 
 		 478 aa  47  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0029  transposition helper protein  26.21 
 
 		 311 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0016  AAA ATPase  25 
 
 		 312 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3578  TniB family protein  24.55 
 
 		 308 aa  43.9  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0550246  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  29.41 
 
 		 1093 aa  43.5  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>