32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_4322 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_4322  hypothetical protein  100 
 
 
478 aa  986    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1115  Tn7-like transposition protein C  33.51 
 
 
551 aa  224  3e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5723  Tn7-like transposition protein C  30.95 
 
 
488 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7025  Tn7-like transposition protein C  32.34 
 
 
352 aa  206  5e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.388572  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0184  Tn7-like transposition protein C  33.42 
 
 
555 aa  205  1e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3952  Tn7-like transposition protein C  32.55 
 
 
500 aa  197  3e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0247  AAA ATPase  31.2 
 
 
562 aa  196  9e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.472515 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5193  Tn7-like transposition protein C  31.02 
 
 
467 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0144  Tn7-like transposition protein C  29.38 
 
 
559 aa  190  4e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.23135  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1872  Tn7-like transposition protein C  31.61 
 
 
551 aa  189  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2325  Tn7-like transposition protein C  30.36 
 
 
568 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000840963 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3949  Tn7-like transposition protein C  30.79 
 
 
565 aa  177  5e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3488  Tn7-like transposition protein C  30.95 
 
 
556 aa  172  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00656002  normal  0.0745204 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0176  Tn7-like transposition protein C  29.67 
 
 
550 aa  169  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3945  transposon Tn7 transposition protein TnsC  28.38 
 
 
536 aa  168  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2930  hypothetical protein  28.42 
 
 
530 aa  154  4e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6967  Tn7-like transposition protein C  30.21 
 
 
540 aa  154  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.827899  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6941  hypothetical protein  27.91 
 
 
470 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0945854  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3934  AAA ATPase  29.03 
 
 
546 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1203  Tn5468, transposition protein C  28.65 
 
 
552 aa  147  3e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3826  transposon Tn7 transposition protein TnsC  28.23 
 
 
545 aa  146  8.000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109282 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2801  Tn7-like transposition protein C  29.03 
 
 
551 aa  144  5e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3197  Tn5468, transposition protein C  29.03 
 
 
551 aa  144  5e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4358  transposon Tn7 transposition protein TnsC  27.48 
 
 
552 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4972  hypothetical protein  29.91 
 
 
549 aa  96.3  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3107  transposon Tn7 transposition protein C  24.41 
 
 
490 aa  78.6  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0459795 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1176  hypothetical protein  23.51 
 
 
485 aa  73.9  0.000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2234  AAA ATPase  26.77 
 
 
304 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.389055  decreased coverage  0.000860852 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1591  TniB  21.76 
 
 
313 aa  47.4  0.0006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.545721  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0694  TniB  21.76 
 
 
313 aa  47.4  0.0006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2089  hypothetical protein  22.45 
 
 
356 aa  47  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.705545  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0203  TniB family protein  22.13 
 
 
296 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000461538 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>