32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0144 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0144  Tn7-like transposition protein C  100 
 
 		 559 aa  1149    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.23135  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0184  Tn7-like transposition protein C  39.25 
 
 		 555 aa  391  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1115  Tn7-like transposition protein C  40.37 
 
 		 551 aa  390  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1872  Tn7-like transposition protein C  44.33 
 
 		 551 aa  338  9.999999999999999e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3197  Tn5468, transposition protein C  36.78 
 
 		 551 aa  337  3.9999999999999995e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2801  Tn7-like transposition protein C  36.78 
 
 		 551 aa  337  3.9999999999999995e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1203  Tn5468, transposition protein C  36.07 
 
 		 552 aa  335  9e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2325  Tn7-like transposition protein C  34.49 
 
 		 568 aa  318  1e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000840963 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3949  Tn7-like transposition protein C  34.88 
 
 		 565 aa  317  3e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0176  Tn7-like transposition protein C  33.58 
 
 		 550 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3952  Tn7-like transposition protein C  37.05 
 
 		 500 aa  295  1e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3488  Tn7-like transposition protein C  32.79 
 
 		 556 aa  290  4e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00656002  normal  0.0745204 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3945  transposon Tn7 transposition protein TnsC  37.71 
 
 		 536 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5723  Tn7-like transposition protein C  38.33 
 
 		 488 aa  277  3e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0247  AAA ATPase  30.6 
 
 		 562 aa  256  8e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.472515 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2930  hypothetical protein  35.4 
 
 		 530 aa  253  9.000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4358  transposon Tn7 transposition protein TnsC  35.56 
 
 		 552 aa  248  2e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3934  AAA ATPase  35.01 
 
 		 546 aa  246  9e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5193  Tn7-like transposition protein C  36.48 
 
 		 467 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7025  Tn7-like transposition protein C  39.7 
 
 		 352 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.388572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3826  transposon Tn7 transposition protein TnsC  34.36 
 
 		 545 aa  239  1e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109282 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6967  Tn7-like transposition protein C  33.93 
 
 		 540 aa  220  5e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.827899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4322  hypothetical protein  29.38 
 
 		 478 aa  190  5e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6941  hypothetical protein  30.39 
 
 		 470 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0945854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4972  hypothetical protein  23.61 
 
 		 549 aa  95.5  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1176  hypothetical protein  25.19 
 
 		 485 aa  89  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3107  transposon Tn7 transposition protein C  23.61 
 
 		 490 aa  86.7  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0459795 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2206  hypothetical protein  29.6 
 
 		 234 aa  83.6  0.000000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2234  AAA ATPase  23.38 
 
 		 304 aa  58.9  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.389055  decreased coverage  0.000860852 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1646  TniB  25.47 
 
 		 300 aa  46.2  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0376  hypothetical protein  22.87 
 
 		 330 aa  46.2  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1630  hypothetical protein  28.08 
 
 		 313 aa  45.1  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>