36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2801 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_3197  Tn5468, transposition protein C  100 
 
 		 551 aa  1127    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1203  Tn5468, transposition protein C  85.45 
 
 		 552 aa  945    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2801  Tn7-like transposition protein C  100 
 
 		 551 aa  1127    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1115  Tn7-like transposition protein C  39.19 
 
 		 551 aa  389  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1872  Tn7-like transposition protein C  39.23 
 
 		 551 aa  367  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0176  Tn7-like transposition protein C  36.03 
 
 		 550 aa  357  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3945  transposon Tn7 transposition protein TnsC  37.36 
 
 		 536 aa  355  1e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3488  Tn7-like transposition protein C  37.59 
 
 		 556 aa  347  4e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00656002  normal  0.0745204 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0144  Tn7-like transposition protein C  36.78 
 
 		 559 aa  343  4e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.23135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3934  AAA ATPase  36.51 
 
 		 546 aa  339  7e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0184  Tn7-like transposition protein C  35.28 
 
 		 555 aa  333  7.000000000000001e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2325  Tn7-like transposition protein C  35.9 
 
 		 568 aa  330  4e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000840963 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3826  transposon Tn7 transposition protein TnsC  34.94 
 
 		 545 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109282 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3949  Tn7-like transposition protein C  42.16 
 
 		 565 aa  321  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4358  transposon Tn7 transposition protein TnsC  34.07 
 
 		 552 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2930  hypothetical protein  35.77 
 
 		 530 aa  299  1e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3952  Tn7-like transposition protein C  34.92 
 
 		 500 aa  276  7e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5723  Tn7-like transposition protein C  37.38 
 
 		 488 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5193  Tn7-like transposition protein C  36.76 
 
 		 467 aa  274  3e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0247  AAA ATPase  32.61 
 
 		 562 aa  270  4e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.472515 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7025  Tn7-like transposition protein C  39.94 
 
 		 352 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.388572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6967  Tn7-like transposition protein C  34.34 
 
 		 540 aa  231  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.827899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6941  hypothetical protein  27.78 
 
 		 470 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0945854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4322  hypothetical protein  29.03 
 
 		 478 aa  144  5e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3107  transposon Tn7 transposition protein C  25.66 
 
 		 490 aa  108  3e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0459795 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2206  hypothetical protein  45.63 
 
 		 234 aa  95.5  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1176  hypothetical protein  27.54 
 
 		 485 aa  91.7  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4972  hypothetical protein  23.69 
 
 		 549 aa  84  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2234  AAA ATPase  21.29 
 
 		 304 aa  51.2  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.389055  decreased coverage  0.000860852 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1630  hypothetical protein  21.65 
 
 		 313 aa  50.4  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5404  transposition protein, TnsC-related protein  25.33 
 
 		 448 aa  50.4  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0234702 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6260  TniB  26.29 
 
 		 289 aa  46.6  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3569  AAA ATPase  26.62 
 
 		 338 aa  43.9  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.628974 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1646  TniB  25.4 
 
 		 300 aa  43.9  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3048  TniB  23.48 
 
 		 303 aa  43.9  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.37719 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2504  transposon transposition helper protein C, putative  24.29 
 
 		 294 aa  43.9  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.059168  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>