49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0247 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_0247  AAA ATPase  100 
 
 		 562 aa  1151    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.472515 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1115  Tn7-like transposition protein C  43.14 
 
 		 551 aa  340  2.9999999999999998e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0176  Tn7-like transposition protein C  36.45 
 
 		 550 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1872  Tn7-like transposition protein C  34.48 
 
 		 551 aa  310  4e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5723  Tn7-like transposition protein C  36.86 
 
 		 488 aa  294  3e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3934  AAA ATPase  37.26 
 
 		 546 aa  282  1e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0184  Tn7-like transposition protein C  32.32 
 
 		 555 aa  277  3e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1203  Tn5468, transposition protein C  32.16 
 
 		 552 aa  277  4e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5193  Tn7-like transposition protein C  38.08 
 
 		 467 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2930  hypothetical protein  33.93 
 
 		 530 aa  273  5.000000000000001e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3949  Tn7-like transposition protein C  31.01 
 
 		 565 aa  273  7e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3945  transposon Tn7 transposition protein TnsC  32.79 
 
 		 536 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2801  Tn7-like transposition protein C  32.61 
 
 		 551 aa  270  4e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3197  Tn5468, transposition protein C  32.61 
 
 		 551 aa  270  4e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2325  Tn7-like transposition protein C  35.32 
 
 		 568 aa  266  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000840963 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0144  Tn7-like transposition protein C  29.5 
 
 		 559 aa  261  2e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.23135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3488  Tn7-like transposition protein C  37.41 
 
 		 556 aa  253  8.000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00656002  normal  0.0745204 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3952  Tn7-like transposition protein C  31.72 
 
 		 500 aa  249  1e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3826  transposon Tn7 transposition protein TnsC  34.17 
 
 		 545 aa  248  2e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109282 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4358  transposon Tn7 transposition protein TnsC  33.33 
 
 		 552 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7025  Tn7-like transposition protein C  35.74 
 
 		 352 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.388572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6967  Tn7-like transposition protein C  32.43 
 
 		 540 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.827899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6941  hypothetical protein  29.63 
 
 		 470 aa  203  7e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0945854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4322  hypothetical protein  31.2 
 
 		 478 aa  196  9e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3107  transposon Tn7 transposition protein C  26.73 
 
 		 490 aa  127  7e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0459795 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4972  hypothetical protein  24.03 
 
 		 549 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2206  hypothetical protein  31.65 
 
 		 234 aa  87  9e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1176  hypothetical protein  21.46 
 
 		 485 aa  72.8  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0015  AAA ATPase  27.54 
 
 		 319 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000241771 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0007  AAA ATPase  27.54 
 
 		 319 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00746213  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0009  AAA ATPase  27.54 
 
 		 319 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0992238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0007  AAA ATPase  27.54 
 
 		 319 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4686  TniB family protein  20.4 
 
 		 301 aa  50.8  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.60041  normal  0.0211663 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3861  hypothetical protein  22.76 
 
 		 319 aa  48.9  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0197504 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0188  urease, alpha subunit  25.85 
 
 		 293 aa  48.9  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0376  hypothetical protein  25.57 
 
 		 330 aa  48.5  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0203  TniB family protein  27.11 
 
 		 296 aa  47.8  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000461538 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1518  hypothetical protein  27.04 
 
 		 351 aa  47.4  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.558401  normal  0.288847 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2234  AAA ATPase  29.09 
 
 		 304 aa  47.4  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.389055  decreased coverage  0.000860852 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2266  hypothetical protein  24.03 
 
 		 315 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.339393 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1630  hypothetical protein  25.17 
 
 		 313 aa  46.2  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4199  hypothetical protein  20.54 
 
 		 340 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0730  transposition protein, putative  26.47 
 
 		 316 aa  45.4  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.12407  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1646  TniB  24.83 
 
 		 300 aa  45.1  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0124  putative NTP-binding protein TniB  22.58 
 
 		 298 aa  45.1  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2176  hypothetical protein  32.89 
 
 		 316 aa  44.7  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.476118  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0026  hypothetical protein  22.22 
 
 		 379 aa  44.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4580  TniB  23.11 
 
 		 307 aa  43.9  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0219  TniB family protein  23.44 
 
 		 325 aa  43.9  0.009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.858856  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>