33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6941 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6941  hypothetical protein  100 
 
 
470 aa  974    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0945854  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0247  AAA ATPase  29.56 
 
 
562 aa  202  7e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.472515 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1115  Tn7-like transposition protein C  30.6 
 
 
551 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5723  Tn7-like transposition protein C  31.67 
 
 
488 aa  201  3e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1872  Tn7-like transposition protein C  30.42 
 
 
551 aa  195  2e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5193  Tn7-like transposition protein C  30.75 
 
 
467 aa  194  4e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3934  AAA ATPase  30.41 
 
 
546 aa  189  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7025  Tn7-like transposition protein C  31.69 
 
 
352 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.388572  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0176  Tn7-like transposition protein C  29.51 
 
 
550 aa  179  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0144  Tn7-like transposition protein C  30.39 
 
 
559 aa  169  9e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.23135  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4358  transposon Tn7 transposition protein TnsC  29.1 
 
 
552 aa  167  4e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2930  hypothetical protein  27.76 
 
 
530 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1203  Tn5468, transposition protein C  29.16 
 
 
552 aa  157  4e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3952  Tn7-like transposition protein C  26.96 
 
 
500 aa  155  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0184  Tn7-like transposition protein C  25.96 
 
 
555 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2801  Tn7-like transposition protein C  27.78 
 
 
551 aa  153  5.9999999999999996e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3197  Tn5468, transposition protein C  27.78 
 
 
551 aa  153  5.9999999999999996e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3826  transposon Tn7 transposition protein TnsC  27.83 
 
 
545 aa  152  8e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109282 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4322  hypothetical protein  27.91 
 
 
478 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3949  Tn7-like transposition protein C  28.04 
 
 
565 aa  141  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2325  Tn7-like transposition protein C  26.64 
 
 
568 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000840963 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3488  Tn7-like transposition protein C  27.18 
 
 
556 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00656002  normal  0.0745204 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6967  Tn7-like transposition protein C  27.83 
 
 
540 aa  123  6e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.827899  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3945  transposon Tn7 transposition protein TnsC  25 
 
 
536 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4972  hypothetical protein  24.23 
 
 
549 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3107  transposon Tn7 transposition protein C  24.23 
 
 
490 aa  61.2  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0459795 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1176  hypothetical protein  25.89 
 
 
485 aa  48.9  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5057  hypothetical protein  23.83 
 
 
312 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.847367  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5217  hypothetical protein  23.83 
 
 
312 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.736835  normal  0.213042 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3151  hypothetical protein  23.83 
 
 
312 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0376  hypothetical protein  27.03 
 
 
330 aa  45.1  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2206  hypothetical protein  25.19 
 
 
234 aa  45.1  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1630  hypothetical protein  21.81 
 
 
313 aa  43.1  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>