45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6967 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6967  Tn7-like transposition protein C  100 
 
 		 540 aa  1111    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.827899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1115  Tn7-like transposition protein C  32.32 
 
 		 551 aa  264  3e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3945  transposon Tn7 transposition protein TnsC  32.7 
 
 		 536 aa  243  5e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0184  Tn7-like transposition protein C  31.91 
 
 		 555 aa  231  2e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3197  Tn5468, transposition protein C  34.34 
 
 		 551 aa  231  3e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1203  Tn5468, transposition protein C  34.41 
 
 		 552 aa  231  3e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2801  Tn7-like transposition protein C  34.34 
 
 		 551 aa  231  3e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2325  Tn7-like transposition protein C  34.38 
 
 		 568 aa  230  6e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000840963 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1872  Tn7-like transposition protein C  35.68 
 
 		 551 aa  229  7e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3952  Tn7-like transposition protein C  33.83 
 
 		 500 aa  229  1e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0176  Tn7-like transposition protein C  30.15 
 
 		 550 aa  229  1e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3949  Tn7-like transposition protein C  36.43 
 
 		 565 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0144  Tn7-like transposition protein C  33.93 
 
 		 559 aa  220  3.9999999999999997e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.23135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3488  Tn7-like transposition protein C  32.12 
 
 		 556 aa  217  5e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00656002  normal  0.0745204 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0247  AAA ATPase  32.43 
 
 		 562 aa  213  7.999999999999999e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.472515 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3934  AAA ATPase  34.16 
 
 		 546 aa  211  2e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3826  transposon Tn7 transposition protein TnsC  33.09 
 
 		 545 aa  204  4e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109282 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2930  hypothetical protein  31.02 
 
 		 530 aa  196  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4358  transposon Tn7 transposition protein TnsC  31.41 
 
 		 552 aa  194  4e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5723  Tn7-like transposition protein C  30.68 
 
 		 488 aa  187  4e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7025  Tn7-like transposition protein C  32.14 
 
 		 352 aa  178  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.388572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5193  Tn7-like transposition protein C  29.79 
 
 		 467 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4322  hypothetical protein  30.21 
 
 		 478 aa  154  5e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4972  hypothetical protein  25.15 
 
 		 549 aa  136  9e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3107  transposon Tn7 transposition protein C  29.15 
 
 		 490 aa  125  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0459795 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6941  hypothetical protein  27.83 
 
 		 470 aa  123  7e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0945854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1176  hypothetical protein  24.3 
 
 		 485 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2206  hypothetical protein  26.16 
 
 		 234 aa  70.5  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1646  TniB  24 
 
 		 300 aa  63.9  0.000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4580  TniB  26.34 
 
 		 307 aa  53.5  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0188  urease, alpha subunit  23.81 
 
 		 293 aa  52.8  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4235  hypothetical protein  25.41 
 
 		 292 aa  50.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.814526 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0219  TniB family protein  25.35 
 
 		 325 aa  48.5  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.858856  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0124  putative NTP-binding protein TniB  19.34 
 
 		 298 aa  47.8  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2234  AAA ATPase  28.75 
 
 		 304 aa  47  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.389055  decreased coverage  0.000860852 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1591  TniB  20.78 
 
 		 313 aa  46.6  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.545721  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0694  TniB  20.78 
 
 		 313 aa  46.6  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1223  TniB family protein  24.1 
 
 		 298 aa  45.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.985075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1347  TniB family protein  24.1 
 
 		 298 aa  45.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2172  TniB family protein  24.1 
 
 		 298 aa  45.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.248869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2647  TniB family protein  24.1 
 
 		 298 aa  45.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.288166  normal  0.0374868 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4383  TniB  20.5 
 
 		 293 aa  43.5  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0720685  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4305  TniB  20.5 
 
 		 293 aa  43.5  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.893182  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4221  TniB  20.5 
 
 		 293 aa  43.5  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341366  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4603  TniB  20.5 
 
 		 293 aa  43.5  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.956661  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>