44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_0176 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_0176  Tn7-like transposition protein C  100 
 
 
550 aa  1129    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1115  Tn7-like transposition protein C  46.98 
 
 
551 aa  498  1e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1872  Tn7-like transposition protein C  43.07 
 
 
551 aa  426  1e-118  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0184  Tn7-like transposition protein C  37.96 
 
 
555 aa  378  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2325  Tn7-like transposition protein C  36.67 
 
 
568 aa  376  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000840963 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3197  Tn5468, transposition protein C  35.6 
 
 
551 aa  369  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2801  Tn7-like transposition protein C  35.6 
 
 
551 aa  369  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3949  Tn7-like transposition protein C  36.56 
 
 
565 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3488  Tn7-like transposition protein C  37.27 
 
 
556 aa  362  8e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00656002  normal  0.0745204 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1203  Tn5468, transposition protein C  35.41 
 
 
552 aa  356  6.999999999999999e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3945  transposon Tn7 transposition protein TnsC  36.5 
 
 
536 aa  345  1e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0144  Tn7-like transposition protein C  33.58 
 
 
559 aa  327  3e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.23135  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0247  AAA ATPase  35.41 
 
 
562 aa  315  1.9999999999999998e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.472515 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3952  Tn7-like transposition protein C  40.2 
 
 
500 aa  304  2.0000000000000002e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3934  AAA ATPase  35.71 
 
 
546 aa  300  3e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4358  transposon Tn7 transposition protein TnsC  32.81 
 
 
552 aa  294  3e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3826  transposon Tn7 transposition protein TnsC  33.94 
 
 
545 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109282 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5723  Tn7-like transposition protein C  36.84 
 
 
488 aa  283  7.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2930  hypothetical protein  35.08 
 
 
530 aa  278  1e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2206  hypothetical protein  61.11 
 
 
234 aa  258  2e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5193  Tn7-like transposition protein C  35.13 
 
 
467 aa  247  4e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6967  Tn7-like transposition protein C  28.88 
 
 
540 aa  237  3e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.827899  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7025  Tn7-like transposition protein C  37.5 
 
 
352 aa  231  4e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.388572  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6941  hypothetical protein  29.51 
 
 
470 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0945854  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4322  hypothetical protein  29.67 
 
 
478 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3107  transposon Tn7 transposition protein C  25.71 
 
 
490 aa  130  5.0000000000000004e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0459795 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1176  hypothetical protein  24.95 
 
 
485 aa  96.3  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4972  hypothetical protein  21.69 
 
 
549 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2234  AAA ATPase  25.21 
 
 
304 aa  55.8  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.389055  decreased coverage  0.000860852 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1646  TniB  24.19 
 
 
300 aa  54.7  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0203  TniB family protein  23.27 
 
 
296 aa  48.9  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000461538 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0124  putative NTP-binding protein TniB  26.63 
 
 
298 aa  48.9  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0376  hypothetical protein  25.53 
 
 
330 aa  47  0.0008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2504  transposon transposition helper protein C, putative  22.45 
 
 
294 aa  47  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.059168  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0009  AAA ATPase  24.44 
 
 
319 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0992238  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0015  AAA ATPase  24.44 
 
 
319 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000241771 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0007  AAA ATPase  24.44 
 
 
319 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00746213  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0007  AAA ATPase  24.44 
 
 
319 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4721  AAA ATPase  26.14 
 
 
327 aa  45.8  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.895386  normal  0.068339 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4686  TniB family protein  23.6 
 
 
301 aa  44.7  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.60041  normal  0.0211663 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1630  hypothetical protein  26.24 
 
 
313 aa  45.1  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0730  transposition protein, putative  27.27 
 
 
316 aa  44.7  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.12407  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4235  hypothetical protein  22.61 
 
 
292 aa  43.9  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.814526 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3048  TniB  22.22 
 
 
303 aa  43.9  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.37719 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>