202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0124 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0124  putative NTP-binding protein TniB  100 
 
 		 298 aa  613  9.999999999999999e-175  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1646  TniB  50.69 
 
 		 300 aa  305  7e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3009  hypothetical protein  47.7 
 
 		 302 aa  271  9e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00246617 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4044  NTP-binding protein TniB  47.7 
 
 		 302 aa  271  9e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160827  normal  0.440608 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4973  NTP-binding protein TniB  47.7 
 
 		 302 aa  271  9e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899984  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0157  transposition protein TniB  49.07 
 
 		 286 aa  263  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3578  TniB family protein  45.71 
 
 		 308 aa  262  4.999999999999999e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0550246  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1174  transposition protein TniB  47 
 
 		 302 aa  256  5e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0203  TniB family protein  46.89 
 
 		 296 aa  252  4.0000000000000004e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000461538 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1223  TniB family protein  42.51 
 
 		 298 aa  229  5e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.985075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1347  TniB family protein  42.51 
 
 		 298 aa  229  5e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2172  TniB family protein  42.51 
 
 		 298 aa  229  5e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.248869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2647  TniB family protein  42.51 
 
 		 298 aa  229  5e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.288166  normal  0.0374868 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2504  transposon transposition helper protein C, putative  41.09 
 
 		 294 aa  228  7e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.059168  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2935  TniB family protein  38.3 
 
 		 301 aa  216  5e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.734369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1681  TniB family protein  38.3 
 
 		 301 aa  216  5e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.844069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4904  TniB  40.52 
 
 		 289 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3259  TniB family protein  40.52 
 
 		 289 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.112641 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4235  hypothetical protein  41.11 
 
 		 292 aa  210  3e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.814526 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6596  TniB family protein  39.71 
 
 		 289 aa  208  7e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0057  transposition helper protein  39.64 
 
 		 296 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1579  TniB family protein  38.18 
 
 		 301 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0154252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4686  TniB family protein  41.82 
 
 		 301 aa  206  3e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.60041  normal  0.0211663 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0188  urease, alpha subunit  39.57 
 
 		 293 aa  204  1e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6260  TniB  39.39 
 
 		 289 aa  203  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2523  TniB family protein  37.23 
 
 		 301 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.122196 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4979  TniB family protein  37.59 
 
 		 301 aa  202  7e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635243 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0694  TniB  36.84 
 
 		 313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1591  TniB  36.84 
 
 		 313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.545721  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3048  TniB  36.59 
 
 		 303 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.37719 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4221  TniB  37.8 
 
 		 293 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341366  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4305  TniB  37.8 
 
 		 293 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.893182  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4383  TniB  37.8 
 
 		 293 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0720685  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4603  TniB  37.8 
 
 		 293 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.956661  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4580  TniB  33.33 
 
 		 307 aa  159  7e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3006  TniB  41.2 
 
 		 497 aa  155  7e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.270037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2132  TniB family protein  41.85 
 
 		 203 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.521965  normal  0.0287257 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0219  TniB family protein  31.47 
 
 		 325 aa  149  6e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.858856  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4287  TniB  35.78 
 
 		 440 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.105258  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4393  TniB  31.41 
 
 		 292 aa  144  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5461  TniB family protein  29.66 
 
 		 297 aa  129  6e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.93146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4507  TniB  29.39 
 
 		 296 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5454  TniB  29.45 
 
 		 167 aa  78.2  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.487668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5455  hypothetical protein  38.74 
 
 		 135 aa  77.8  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.201732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0976  TniB family protein  29.96 
 
 		 276 aa  73.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.104789 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06218  hypothetical protein  25.1 
 
 		 326 aa  72  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2200  uncharacterized ATPase putative transposase  27.11 
 
 		 276 aa  69.3  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.866593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3128  uncharacterized ATPase putative transposase  27.11 
 
 		 276 aa  69.3  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.765042 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2982  TniB family protein  26.94 
 
 		 290 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2603  AAA ATPase  28.77 
 
 		 377 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0342788  normal  0.397066 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1151  hypothetical protein  27.56 
 
 		 278 aa  63.5  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.275843 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4199  hypothetical protein  24.41 
 
 		 340 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0015  AAA ATPase  25.61 
 
 		 319 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000241771 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0009  AAA ATPase  25.61 
 
 		 319 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0992238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0007  AAA ATPase  25.61 
 
 		 319 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0007  AAA ATPase  25.61 
 
 		 319 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00746213  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2234  AAA ATPase  24.66 
 
 		 304 aa  59.3  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.389055  decreased coverage  0.000860852 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3151  hypothetical protein  21.4 
 
 		 312 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5217  hypothetical protein  21.4 
 
 		 312 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.736835  normal  0.213042 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5057  hypothetical protein  21.4 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.847367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4741  AAA ATPase  26.36 
 
 		 335 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3861  hypothetical protein  25.51 
 
 		 319 aa  56.2  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0197504 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1872  Tn7-like transposition protein C  23.75 
 
 		 551 aa  53.5  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3040  TniB  36.67 
 
 		 98 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0016  AAA ATPase  20.75 
 
 		 312 aa  52.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2187  hypothetical protein  26.25 
 
 		 275 aa  52.8  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0229  ATPase  25 
 
 		 870 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.388652 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0595  ATPase AAA-2 domain protein  28.66 
 
 		 851 aa  52  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.190948  normal  0.0636488 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2351  hypothetical protein  21.43 
 
 		 310 aa  51.6  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0363942 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4335  ATPase AAA-2 domain protein  27.39 
 
 		 840 aa  51.6  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1982  AAA ATPase  24.84 
 
 		 382 aa  50.8  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.135129 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4356  ATPase AAA-2  26.06 
 
 		 869 aa  50.8  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.508325 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3404  ATPase AAA-2 domain protein  29.09 
 
 		 843 aa  50.4  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0363  ATPase AAA-2 domain protein  28.74 
 
 		 852 aa  50.1  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4753  hypothetical protein  24.39 
 
 		 362 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.713653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2751  negative regulator of genetic competence MecB/ClpC  25.13 
 
 		 814 aa  49.7  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0335  ATPase AAA-2 domain protein  27.52 
 
 		 852 aa  49.7  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00535143  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3260  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  26.78 
 
 		 751 aa  49.7  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.625652  hitchhiker  0.000000000240125 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0449  ATPase AAA-2 domain protein  26.85 
 
 		 842 aa  49.3  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.673117 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3055  ATPase AAA-2 domain protein  28.74 
 
 		 858 aa  49.7  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0115492 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2437  negative regulator of genetic competence MecB/ClpC  25.52 
 
 		 814 aa  49.3  0.00008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3107  transposon Tn7 transposition protein C  23.57 
 
 		 490 aa  49.3  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0459795 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5193  Tn7-like transposition protein C  23.79 
 
 		 467 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11320  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  24.34 
 
 		 846 aa  49.3  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.952833  normal  0.628396 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0176  Tn7-like transposition protein C  26.63 
 
 		 550 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0376  hypothetical protein  22.46 
 
 		 330 aa  48.5  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05080  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  27.52 
 
 		 858 aa  48.1  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1215  ATPase AAA-2  26.32 
 
 		 745 aa  47.4  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.26659  normal  0.784865 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3412  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  28.29 
 
 		 756 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.117396 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6967  Tn7-like transposition protein C  19.34 
 
 		 540 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.827899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1789  ATPase AAA-2  26.85 
 
 		 818 aa  47.4  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.607583  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4008  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  28.29 
 
 		 756 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0728152 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1934  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  28.25 
 
 		 778 aa  47  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1825  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  28.29 
 
 		 756 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0620504 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3613  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  28.29 
 
 		 756 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0572282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0887  ATP-dependent chaperone ClpB  28 
 
 		 854 aa  46.6  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.763856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29402  chaperone, Hsp100 family, ClpC-type  25.32 
 
 		 840 aa  46.6  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0120883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0578  ATP-dependent chaperone ClpB  24.6 
 
 		 868 aa  46.2  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0466  ATPase  28.19 
 
 		 861 aa  46.2  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5592  AAA ATPase  24.88 
 
 		 393 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>