33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3826 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3826  transposon Tn7 transposition protein TnsC  100 
 
 		 545 aa  1125    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109282 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4358  transposon Tn7 transposition protein TnsC  54.63 
 
 		 552 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3934  AAA ATPase  50.55 
 
 		 546 aa  545  1e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3945  transposon Tn7 transposition protein TnsC  43.47 
 
 		 536 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1115  Tn7-like transposition protein C  36.94 
 
 		 551 aa  332  1e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3197  Tn5468, transposition protein C  34.94 
 
 		 551 aa  317  4e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2801  Tn7-like transposition protein C  34.94 
 
 		 551 aa  317  4e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1203  Tn5468, transposition protein C  34.54 
 
 		 552 aa  309  1.0000000000000001e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2930  hypothetical protein  35.93 
 
 		 530 aa  297  3e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1872  Tn7-like transposition protein C  34.77 
 
 		 551 aa  284  3.0000000000000004e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0184  Tn7-like transposition protein C  34.12 
 
 		 555 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0176  Tn7-like transposition protein C  33.94 
 
 		 550 aa  270  7e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2325  Tn7-like transposition protein C  36.17 
 
 		 568 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000840963 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0247  AAA ATPase  34.17 
 
 		 562 aa  248  2e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.472515 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3952  Tn7-like transposition protein C  36.15 
 
 		 500 aa  246  6.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3949  Tn7-like transposition protein C  37.31 
 
 		 565 aa  243  6e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3488  Tn7-like transposition protein C  36.21 
 
 		 556 aa  243  7e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00656002  normal  0.0745204 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5723  Tn7-like transposition protein C  38.79 
 
 		 488 aa  242  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0144  Tn7-like transposition protein C  34.36 
 
 		 559 aa  239  1e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.23135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7025  Tn7-like transposition protein C  39.94 
 
 		 352 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.388572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5193  Tn7-like transposition protein C  35.5 
 
 		 467 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6967  Tn7-like transposition protein C  33.09 
 
 		 540 aa  204  4e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.827899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6941  hypothetical protein  27.83 
 
 		 470 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0945854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4322  hypothetical protein  28.23 
 
 		 478 aa  146  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3107  transposon Tn7 transposition protein C  25.4 
 
 		 490 aa  119  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0459795 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1176  hypothetical protein  23.66 
 
 		 485 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4972  hypothetical protein  24.33 
 
 		 549 aa  80.5  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2206  hypothetical protein  42.7 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2351  hypothetical protein  27.43 
 
 		 310 aa  55.1  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0363942 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1646  TniB  23.32 
 
 		 300 aa  48.5  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2234  AAA ATPase  27.56 
 
 		 304 aa  44.3  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.389055  decreased coverage  0.000860852 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0376  hypothetical protein  24.84 
 
 		 330 aa  43.9  0.008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0188  urease, alpha subunit  22.27 
 
 		 293 aa  43.5  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>