44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7025 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_7025  Tn7-like transposition protein C  100 
 
 		 352 aa  717    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.388572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5723  Tn7-like transposition protein C  54.94 
 
 		 488 aa  375  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5193  Tn7-like transposition protein C  50.46 
 
 		 467 aa  325  5e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1115  Tn7-like transposition protein C  41.28 
 
 		 551 aa  289  6e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3952  Tn7-like transposition protein C  41.09 
 
 		 500 aa  253  5.000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1203  Tn5468, transposition protein C  41 
 
 		 552 aa  249  4e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0184  Tn7-like transposition protein C  38.48 
 
 		 555 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3945  transposon Tn7 transposition protein TnsC  42.77 
 
 		 536 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0144  Tn7-like transposition protein C  39.7 
 
 		 559 aa  241  1e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.23135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1872  Tn7-like transposition protein C  36.6 
 
 		 551 aa  240  2.9999999999999997e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3197  Tn5468, transposition protein C  39.94 
 
 		 551 aa  239  5e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2801  Tn7-like transposition protein C  39.94 
 
 		 551 aa  239  5e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3934  AAA ATPase  41 
 
 		 546 aa  238  2e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0247  AAA ATPase  35.74 
 
 		 562 aa  236  3e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.472515 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4358  transposon Tn7 transposition protein TnsC  38.44 
 
 		 552 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3826  transposon Tn7 transposition protein TnsC  39.94 
 
 		 545 aa  222  9e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109282 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3949  Tn7-like transposition protein C  37.65 
 
 		 565 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0176  Tn7-like transposition protein C  37.5 
 
 		 550 aa  218  1e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2325  Tn7-like transposition protein C  37.61 
 
 		 568 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000840963 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2930  hypothetical protein  36.69 
 
 		 530 aa  211  1e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3488  Tn7-like transposition protein C  36.64 
 
 		 556 aa  207  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00656002  normal  0.0745204 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4322  hypothetical protein  32.34 
 
 		 478 aa  206  4e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6941  hypothetical protein  31.69 
 
 		 470 aa  180  4e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0945854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6967  Tn7-like transposition protein C  32.14 
 
 		 540 aa  178  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.827899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3107  transposon Tn7 transposition protein C  29.38 
 
 		 490 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0459795 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4972  hypothetical protein  26.69 
 
 		 549 aa  86.3  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1176  hypothetical protein  26.07 
 
 		 485 aa  79  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2206  hypothetical protein  41.33 
 
 		 234 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2234  AAA ATPase  30.06 
 
 		 304 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.389055  decreased coverage  0.000860852 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1646  TniB  24.29 
 
 		 300 aa  52  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2504  transposon transposition helper protein C, putative  22.66 
 
 		 294 aa  51.2  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.059168  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2266  hypothetical protein  28.39 
 
 		 315 aa  47  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.339393 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1174  transposition protein TniB  28.57 
 
 		 302 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1714  ATPase  22.98 
 
 		 492 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1331  ATPase  22.98 
 
 		 492 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0192  ATPase  22.98 
 
 		 492 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.866299  normal  0.0299371 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4945  ATPase  22.98 
 
 		 492 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.206072 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0066  ATPase  22.98 
 
 		 492 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0157  transposition protein TniB  26.45 
 
 		 286 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0203  TniB family protein  23.67 
 
 		 296 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000461538 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3578  TniB family protein  25.3 
 
 		 308 aa  43.1  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0550246  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0188  urease, alpha subunit  23.13 
 
 		 293 aa  43.1  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2132  TniB family protein  23.27 
 
 		 203 aa  42.7  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.521965  normal  0.0287257 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5454  TniB  25.18 
 
 		 167 aa  42.7  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.487668  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>