45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5454 on replicon NC_010333
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010333  Caul_5454  TniB  100 
 
 		 167 aa  335  1.9999999999999998e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.487668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5461  TniB family protein  66.01 
 
 		 297 aa  206  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.93146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3578  TniB family protein  38.89 
 
 		 308 aa  94.4  6e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0550246  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4603  TniB  36.84 
 
 		 293 aa  94  8e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.956661  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4383  TniB  36.84 
 
 		 293 aa  94  8e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0720685  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4305  TniB  36.84 
 
 		 293 aa  94  8e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.893182  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4221  TniB  36.84 
 
 		 293 aa  94  8e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341366  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4580  TniB  38.69 
 
 		 307 aa  93.6  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0694  TniB  32.87 
 
 		 313 aa  91.7  4e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1591  TniB  32.87 
 
 		 313 aa  91.7  4e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.545721  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3009  hypothetical protein  35.81 
 
 		 302 aa  84  9e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00246617 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4973  NTP-binding protein TniB  35.81 
 
 		 302 aa  84  9e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899984  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4044  NTP-binding protein TniB  35.81 
 
 		 302 aa  84  9e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160827  normal  0.440608 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1646  TniB  35.29 
 
 		 300 aa  83.2  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4686  TniB family protein  36.5 
 
 		 301 aa  83.2  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.60041  normal  0.0211663 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1579  TniB family protein  34.34 
 
 		 301 aa  80.1  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0154252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0157  transposition protein TniB  37.24 
 
 		 286 aa  80.5  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1681  TniB family protein  33.73 
 
 		 301 aa  78.6  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.844069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2935  TniB family protein  33.73 
 
 		 301 aa  78.6  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.734369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0124  putative NTP-binding protein TniB  29.45 
 
 		 298 aa  78.2  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4235  hypothetical protein  31.65 
 
 		 292 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.814526 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2523  TniB family protein  31.97 
 
 		 301 aa  75.5  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.122196 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4979  TniB family protein  32.32 
 
 		 301 aa  74.3  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635243 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0203  TniB family protein  32.85 
 
 		 296 aa  74.3  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000461538 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3006  TniB  38.78 
 
 		 497 aa  73.9  0.0000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.270037  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0057  transposition helper protein  31.39 
 
 		 296 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3259  TniB family protein  32.12 
 
 		 289 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.112641 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4904  TniB  32.12 
 
 		 289 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2504  transposon transposition helper protein C, putative  31.39 
 
 		 294 aa  70.9  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.059168  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6596  TniB family protein  31.88 
 
 		 289 aa  70.9  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0219  TniB family protein  26.15 
 
 		 325 aa  70.1  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.858856  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6260  TniB  30.66 
 
 		 289 aa  68.9  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3048  TniB  30 
 
 		 303 aa  67.8  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.37719 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1174  transposition protein TniB  38.78 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2647  TniB family protein  33.8 
 
 		 298 aa  65.1  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.288166  normal  0.0374868 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4287  TniB  45 
 
 		 440 aa  65.5  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.105258  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1223  TniB family protein  33.8 
 
 		 298 aa  65.1  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.985075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1347  TniB family protein  33.8 
 
 		 298 aa  65.1  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2172  TniB family protein  33.8 
 
 		 298 aa  65.1  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.248869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0188  urease, alpha subunit  26.62 
 
 		 293 aa  62.4  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4393  TniB  25.35 
 
 		 292 aa  53.9  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2132  TniB family protein  37.31 
 
 		 203 aa  49.7  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.521965  normal  0.0287257 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4507  TniB  29.37 
 
 		 296 aa  48.1  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3107  transposon Tn7 transposition protein C  23.08 
 
 		 490 aa  46.6  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0459795 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7025  Tn7-like transposition protein C  25.18 
 
 		 352 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.388572  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>