45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4507 on replicon NC_007960
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007960  Nham_4507  TniB  100 
 
 		 296 aa  588  1e-167  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4393  TniB  57.97 
 
 		 292 aa  338  5.9999999999999996e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3578  TniB family protein  33.67 
 
 		 308 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0550246  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4973  NTP-binding protein TniB  33.1 
 
 		 302 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899984  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4044  NTP-binding protein TniB  33.1 
 
 		 302 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160827  normal  0.440608 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3009  hypothetical protein  33.1 
 
 		 302 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00246617 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1223  TniB family protein  35.05 
 
 		 298 aa  133  3e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.985075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1347  TniB family protein  35.05 
 
 		 298 aa  133  3e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2172  TniB family protein  35.05 
 
 		 298 aa  133  3e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.248869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2647  TniB family protein  35.05 
 
 		 298 aa  133  3e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.288166  normal  0.0374868 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0188  urease, alpha subunit  29.02 
 
 		 293 aa  131  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1646  TniB  30.03 
 
 		 300 aa  129  8.000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0157  transposition protein TniB  32.23 
 
 		 286 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0124  putative NTP-binding protein TniB  29.39 
 
 		 298 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1174  transposition protein TniB  32.74 
 
 		 302 aa  120  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2523  TniB family protein  28.67 
 
 		 301 aa  119  6e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.122196 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1579  TniB family protein  28.03 
 
 		 301 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0154252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4979  TniB family protein  28.67 
 
 		 301 aa  116  5e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635243 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2935  TniB family protein  27.27 
 
 		 301 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.734369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1681  TniB family protein  27.27 
 
 		 301 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.844069  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0203  TniB family protein  28.52 
 
 		 296 aa  105  9e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000461538 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1591  TniB  25.64 
 
 		 313 aa  105  1e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.545721  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0694  TniB  25.64 
 
 		 313 aa  105  1e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3259  TniB family protein  31.29 
 
 		 289 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.112641 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4904  TniB  31.29 
 
 		 289 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6260  TniB  30.71 
 
 		 289 aa  100  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2504  transposon transposition helper protein C, putative  24.36 
 
 		 294 aa  99.8  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.059168  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4235  hypothetical protein  30.04 
 
 		 292 aa  97.8  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.814526 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0057  transposition helper protein  26.03 
 
 		 296 aa  95.5  9e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4580  TniB  29.01 
 
 		 307 aa  94.7  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6596  TniB family protein  27.51 
 
 		 289 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4686  TniB family protein  26.64 
 
 		 301 aa  87.8  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.60041  normal  0.0211663 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3048  TniB  24.73 
 
 		 303 aa  86.3  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.37719 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4305  TniB  24.71 
 
 		 293 aa  82.8  0.000000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.893182  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4221  TniB  24.71 
 
 		 293 aa  82.8  0.000000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341366  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4383  TniB  24.71 
 
 		 293 aa  82.8  0.000000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0720685  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4603  TniB  24.71 
 
 		 293 aa  82.8  0.000000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.956661  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0219  TniB family protein  22.53 
 
 		 325 aa  73.6  0.000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.858856  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5461  TniB family protein  26.05 
 
 		 297 aa  71.2  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.93146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5454  TniB  29.37 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.487668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2132  TniB family protein  26.14 
 
 		 203 aa  57  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.521965  normal  0.0287257 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3006  TniB  24.52 
 
 		 497 aa  55.8  0.0000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.270037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4287  TniB  27.48 
 
 		 440 aa  53.5  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.105258  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3040  TniB  29.76 
 
 		 98 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2982  TniB family protein  24.89 
 
 		 290 aa  42.4  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>