54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4393 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008242  Meso_4393  TniB  100 
 
 		 292 aa  583  1e-166  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4507  TniB  57.97 
 
 		 296 aa  321  8e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3578  TniB family protein  32.99 
 
 		 308 aa  149  4e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0550246  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0124  putative NTP-binding protein TniB  31.41 
 
 		 298 aa  144  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0188  urease, alpha subunit  29.93 
 
 		 293 aa  143  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1646  TniB  30.1 
 
 		 300 aa  141  9.999999999999999e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3009  hypothetical protein  33.7 
 
 		 302 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00246617 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4044  NTP-binding protein TniB  33.7 
 
 		 302 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160827  normal  0.440608 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4973  NTP-binding protein TniB  33.7 
 
 		 302 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899984  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2935  TniB family protein  31.47 
 
 		 301 aa  135  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.734369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1681  TniB family protein  31.47 
 
 		 301 aa  135  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.844069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1579  TniB family protein  32.52 
 
 		 301 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0154252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0157  transposition protein TniB  32.82 
 
 		 286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2523  TniB family protein  31.12 
 
 		 301 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.122196 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2647  TniB family protein  33.9 
 
 		 298 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.288166  normal  0.0374868 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1347  TniB family protein  33.9 
 
 		 298 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1223  TniB family protein  33.9 
 
 		 298 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.985075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2172  TniB family protein  33.9 
 
 		 298 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.248869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4235  hypothetical protein  32.71 
 
 		 292 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.814526 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4979  TniB family protein  31.12 
 
 		 301 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635243 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1174  transposition protein TniB  34.06 
 
 		 302 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4686  TniB family protein  30.03 
 
 		 301 aa  126  5e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.60041  normal  0.0211663 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3048  TniB  28.07 
 
 		 303 aa  125  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.37719 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2504  transposon transposition helper protein C, putative  27.66 
 
 		 294 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.059168  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0203  TniB family protein  30.53 
 
 		 296 aa  116  5e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000461538 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0694  TniB  26.62 
 
 		 313 aa  116  5e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1591  TniB  26.62 
 
 		 313 aa  116  5e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.545721  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4904  TniB  30.11 
 
 		 289 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3259  TniB family protein  30.11 
 
 		 289 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.112641 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6260  TniB  31.85 
 
 		 289 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6596  TniB family protein  29.74 
 
 		 289 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0057  transposition helper protein  27.76 
 
 		 296 aa  105  7e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4580  TniB  29.63 
 
 		 307 aa  102  7e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4305  TniB  28.11 
 
 		 293 aa  99.4  7e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.893182  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4221  TniB  28.11 
 
 		 293 aa  99.4  7e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341366  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4383  TniB  28.11 
 
 		 293 aa  99.4  7e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0720685  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4603  TniB  28.11 
 
 		 293 aa  99.4  7e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.956661  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0219  TniB family protein  25.4 
 
 		 325 aa  94.4  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.858856  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5461  TniB family protein  27.06 
 
 		 297 aa  79  0.00000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.93146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3006  TniB  28.84 
 
 		 497 aa  78.6  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.270037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2132  TniB family protein  27.62 
 
 		 203 aa  68.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.521965  normal  0.0287257 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4287  TniB  27.05 
 
 		 440 aa  63.5  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.105258  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5454  TniB  25.35 
 
 		 167 aa  53.9  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.487668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2234  AAA ATPase  22.58 
 
 		 304 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.389055  decreased coverage  0.000860852 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3040  TniB  30.95 
 
 		 98 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1982  AAA ATPase  25.36 
 
 		 382 aa  45.8  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.135129 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5455  hypothetical protein  31.78 
 
 		 135 aa  44.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.201732  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0015  AAA ATPase  24.66 
 
 		 319 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000241771 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0007  AAA ATPase  24.66 
 
 		 319 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00746213  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0007  AAA ATPase  24.66 
 
 		 319 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0009  AAA ATPase  24.66 
 
 		 319 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0992238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2200  uncharacterized ATPase putative transposase  25.11 
 
 		 276 aa  42.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.866593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3128  uncharacterized ATPase putative transposase  25.11 
 
 		 276 aa  42.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.765042 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2604  ABC transporter related  31.16 
 
 		 354 aa  42.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>