55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_2982 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_2982  TniB family protein  100 
 
 
290 aa  595  1e-169  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2187  hypothetical protein  61.7 
 
 
275 aa  371  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2958  hypothetical protein  99.29 
 
 
211 aa  296  2e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1151  hypothetical protein  45.42 
 
 
278 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.275843 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0976  TniB family protein  44.4 
 
 
276 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.104789 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3128  uncharacterized ATPase putative transposase  42.16 
 
 
276 aa  203  3e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.765042 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2200  uncharacterized ATPase putative transposase  42.16 
 
 
276 aa  203  3e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.866593  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1341  hypothetical protein  35.41 
 
 
268 aa  136  4e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.720259  normal  0.280158 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2994  hypothetical protein  25.98 
 
 
296 aa  76.6  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0118  hypothetical protein  27.88 
 
 
302 aa  72  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0113  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0242  hypothetical protein  27.88 
 
 
302 aa  72  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000407838  hitchhiker  0.00123645 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2452  hypothetical protein  27.88 
 
 
302 aa  72  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00352703  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3259  TniB family protein  29.36 
 
 
289 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.112641 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4904  TniB  29.36 
 
 
289 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3578  TniB family protein  24.49 
 
 
308 aa  70.5  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0550246  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0124  putative NTP-binding protein TniB  26.94 
 
 
298 aa  68.6  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0188  urease, alpha subunit  28.79 
 
 
293 aa  67.8  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2504  transposon transposition helper protein C, putative  26.1 
 
 
294 aa  67.4  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.059168  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6260  TniB  28.24 
 
 
289 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0203  TniB family protein  28.12 
 
 
296 aa  66.6  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000461538 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0057  transposition helper protein  25.4 
 
 
296 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4686  TniB family protein  25.76 
 
 
301 aa  60.1  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.60041  normal  0.0211663 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3219  ATP/GTP-binding protein  25.41 
 
 
342 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.184147  normal  0.517488 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6596  TniB family protein  24.67 
 
 
289 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1646  TniB  27.35 
 
 
300 aa  57.4  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3009  hypothetical protein  23.48 
 
 
302 aa  55.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00246617 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4044  NTP-binding protein TniB  23.48 
 
 
302 aa  55.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160827  normal  0.440608 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4973  NTP-binding protein TniB  23.48 
 
 
302 aa  55.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899984  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0157  transposition protein TniB  23.48 
 
 
286 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359337  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1223  TniB family protein  24.12 
 
 
298 aa  52.4  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.985075  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1347  TniB family protein  24.12 
 
 
298 aa  52.4  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2172  TniB family protein  24.12 
 
 
298 aa  52.4  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.248869  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2647  TniB family protein  24.12 
 
 
298 aa  52.4  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.288166  normal  0.0374868 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1591  TniB  23.65 
 
 
313 aa  51.6  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.545721  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0694  TniB  23.65 
 
 
313 aa  51.6  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2953  hypothetical protein  26.06 
 
 
183 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4235  hypothetical protein  28.05 
 
 
292 aa  50.1  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.814526 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4216  Putative ATPase, transposase-like protein  25.29 
 
 
310 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4305  TniB  22.22 
 
 
293 aa  48.9  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.893182  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4221  TniB  22.22 
 
 
293 aa  48.9  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341366  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4603  TniB  22.22 
 
 
293 aa  48.9  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.956661  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4383  TniB  22.22 
 
 
293 aa  48.9  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0720685  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2981  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.65 
 
 
589 aa  47.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0901758 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1174  transposition protein TniB  22.5 
 
 
302 aa  46.6  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4580  TniB  23.56 
 
 
307 aa  46.2  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3182  putative ATP/GTP-binding protein  25.1 
 
 
337 aa  45.8  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18881  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0612  ATP/GTP-binding protein  25.1 
 
 
337 aa  45.8  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.775808  normal 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4979  TniB family protein  20.89 
 
 
301 aa  45.8  0.0009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00635243 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2523  TniB family protein  20.58 
 
 
301 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.122196 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1579  TniB family protein  21.4 
 
 
301 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0154252  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2234  AAA ATPase  26.14 
 
 
304 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.389055  decreased coverage  0.000860852 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2132  TniB family protein  25.85 
 
 
203 aa  43.9  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.521965  normal  0.0287257 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2935  TniB family protein  20.44 
 
 
301 aa  43.5  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.734369  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1681  TniB family protein  20.44 
 
 
301 aa  43.5  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.844069  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0269  bacteriophage DNA transposition protein B, putative  24.66 
 
 
307 aa  42.4  0.009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>